{rfName}
Pr

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

3

Altmetrics

Article has an altmetric score of 4

Grant support

Not applicable.

Anàlisi d'autories institucional

Carro, Esther UgarteAutor o coautorPrieto-Santamaria, LuciaAutor o coautorRodriguez-Gonzalez, AlejandroAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

Protein sequence analysis in the context of drug repurposing

Publicat a:Bmc Medical Informatics And Decision Making. 24 (1): 122- - 2024-05-13 24(1), DOI: 10.1186/s12911-024-02531-1

Autors: Sánchez, NG; Carro, EU; Prieto-Santamaría, L; Rodríguez-González, A

Afiliacions

Resum

Motivation Drug repurposing speeds up the development of new treatments, being less costly, risky, and time consuming than de novo drug discovery. There are numerous biological elements that contribute to the development of diseases and, as a result, to the repurposing of drugs.Methods In this article, we analysed the potential role of protein sequences in drug repurposing scenarios. For this purpose, we embedded the protein sequences by performing four state of the art methods and validated their capacity to encapsulate essential biological information through visualization. Then, we compared the differences in sequence distance between protein-drug target pairs of drug repurposing and non - drug repurposing data. Thus, we were able to uncover patterns that define protein sequences in repurposing cases.Results We found statistically significant sequence distance differences between protein pairs in the repurposing data and the rest of protein pairs in non-repurposing data. In this manner, we verified the potential of using numerical representations of sequences to generate repurposing hypotheses in the future.

Paraules clau

AciClassificationDiseaseDrug repositioningDrug repurposingEfficacyEmbedding vectorEmbedding vectorsGenomeHumanHumansLamotrigineLanguageProtein sequencesSequence analysisSequence analysis, protein

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Bmc Medical Informatics And Decision Making a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2024 encara no hi ha indicis calculats, però el 2023, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Health Policy.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-05-31:

  • Google Scholar: 1
  • WoS: 1
  • Scopus: 1

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-31:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 5.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 5 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 3.2.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 4 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Sanchez, Natalia Garcia) i Últim Autor (RODRIGUEZ GONZALEZ, ALEJANDRO).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat RODRIGUEZ GONZALEZ, ALEJANDRO.