{rfName}
Ef

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

18

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Pérez-González AAutor o coautorCaro EAutor (correspondència)

Compartir

27 dejuny de 2019
Publicacions
>
Article
Sí

Effect of transcription terminator usage on the establishment of transgene transcriptional gene silencing

Publicat a:Bmc Research Notes. 11 (1): 511- - 2018-07-28 11(1), DOI: 10.1186/s13104-018-3649-2

Autors: Pérez-González A; Caro E

Afiliacions

Centro de Biotecnologia y Genomica de Plantas, Universidad Politecnica de Madrid - Autor o coautor

Resum

© 2018 The Author(s). Objective: Obtaining high and stable transgene expression is of vital importance for plant genetic engineering. A lot is known about the relationship between terminator efficiency and gene expression, but no studies have addressed the relationship between terminator usage and transgene expression stability or heritable gene silencing. In this paper, we aim to analyze if terminators are a determining factor in the establishment of promoter DNA methylation of plant transgenes. Results: Our experiments comparing plants with a LUC reporter under the 35S CaMV promoter and good efficiency terminators (Thsp, T35S) show that the use of efficient terminator sequences does not avoid the accumulation of promoter DNA methylation and transgene silencing. However, Thsp lead to a higher reporter gene expression and lower promoter DNA methylation levels than T35S, supporting that terminator usage is indeed involved in the establishment of TGS by methylation of transgenes' promoters. In the case of a terminatorless construct, the PTGS initiated by the improperly terminated mRNAs is not followed by the establishment of heritable silencing in the form of strong promoter DNA methylation, like in the case of TAS genes and reactivated TEs (for the transgene DNA methylation levels remained below the 20%).

Paraules clau

arabidopsisdna methylationptgsrddmsilencingterminatortgsArabidopsisDna methylationGene expression regulation, plantGene silencingGenes, reporterPlants, genetically modifiedPromoter regions, geneticPtgsRddmSilencingTerminatorTgsTranscription, geneticTransgeneTransgenes

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Bmc Research Notes a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2018, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoria Medicine (Miscellaneous).

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-11-03:

  • Scopus: 14
  • Europe PMC: 3

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-11-03:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 48.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 48 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 1.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 3 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (PEREZ GONZALEZ, ANA) i Últim Autor (CARO BERNAT, ELENA).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat CARO BERNAT, ELENA.