{rfName}
Ge

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

32

Altmetrics

Article has an altmetric score of 9

Anàlisi d'autories institucional

Isidro-Sánchez JAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

Genome-wide association mapping of Fusarium langsethiae infection and mycotoxin accumulation in oat (Avena sativa L.)

Publicat a:Plant Genome. 13 (2): e20023- - 2020-07-01 13(2), DOI: 10.1002/tpg2.20023

Autors: Isidro-Sanchez, Julio; Cusack, Kane D'Arcy; Verheecke-Vaessen, Carol; Kahla, Amal; Bekele, Wubishet; Doohan, Fiona; Magan, Naresh; Medina, Angel

Afiliacions

Resum

© 2020 The Authors. The Plant Genome published by Wiley Periodicals, Inc. on behalf of Crop Science Society of America Fusarium langsethiae is a symptomless pathogen of oat panicles that produces T-2 and HT-2 mycotoxins, two of the most potent trichothecenes produced by Fusarium fungi in cereals. In the last few years, the levels of these mycotoxin in oat grain has increased and the European commission have already recommended a maximum level for of 1000 μg kg−1 for unprocessed oat for human consumption. The optimal and most sustainable way of combating infection and mycotoxin contamination is by releasing resistant oat varieties. Here the objective was to determine if we could identify any genomic loci associated with either the accumulation of F. langsethiae DNA or mycotoxins in the grain. In each of two years, field trials were conducted wherein 190 spring oat varieties were inoculated with a mixture of three isolate of the pathogen. Mycotoxins were quantified using liquid chromatography–tandem mass spectrometry. Varieties were genotyped using 16,863 genotyping by sequencing markers. Genome-wide association studies associated 5 SNPs in the linkage group Mr06 with T-2 + HT-2 mycotoxin accumulation. Markers were highly correlated, and a single QTL was identified. The marker avgbs_6K_95238.1 mapped within genes showing similarity to lipase, lipase-like or lipase precursor mRNA sequences and zinc-finger proteins. These regions have previously been shown to confer a significant increase in resistance to Fusarium species.

Paraules clau

AvenaBeta-glucan concentrationFusariumGenome-wide association studyGraminearumHead blightHt-2HumansInfectionsMycotoxinsPopulation-structureQuantificationReal-time pcrResistanceSelectionT-2 toxins

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plant Genome a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 42/235, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.01, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 2.8 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-05, el següent nombre de cites:

  • WoS: 12
  • Scopus: 16
  • Europe PMC: 4
  • OpenCitations: 12

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-05:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 39.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 39 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 8.65.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 13 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
  • Assignació d'un Handle/URN com a identificador dins del Dipòsit en el Repositori Institucional: https://oa.upm.es/86503/

Com a resultat de la publicació del treball en el repositori institucional, s'han obtingut dades estadístiques d'ús que reflecteixen el seu impacte. En termes de difusió, podem afirmar que, fins a la data

  • Visualitzacions: 50
  • Descàrregues: 6

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Canada; Eire; Gran Bretanya; United Kingdom.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (ISIDRO SANCHEZ, JULIO) .

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat ISIDRO SANCHEZ, JULIO.