{rfName}
A

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Fernandez Pacios, LuisAutor o coautorCuevas-Zuviría BAutor o coautorGarrido-Arandia MAutor o coautor

Compartir

17 d’agost de 2020
Publicacions
>
Article

A computational structural study on the DNA-protecting role of the tardigrade-unique Dsup protein

Publicat a:Scientific Reports. 10 (1): 13424- - 2020-12-01 10(1), DOI: 10.1038/s41598-020-70431-1

Autors: Mínguez-Toral M; Cuevas-Zuviría B; Garrido-Arandia M; Pacios LF

Afiliacions

Biotecnología Vegetal. Universidad Politécnica de Madrid - Autor o coautor
Escuela Tecnica Superior de Ingenieros Agronomos de Madrid - Autor o coautor
Instituto Nacional de Investigacion y Tecnologia Agraria y Alimentaria - Autor o coautor

Resum

© 2020, The Author(s). The remarkable ability of tardigrades to withstand a wide range of physical and chemical extremes has attracted a considerable interest in these small invertebrates, with a particular focus on the protective roles of proteins expressed during such conditions. The discovery that a tardigrade-unique protein named Dsup (damage suppressor) protects DNA from damage produced by radiation and radicals, has raised expectations concerning its potential applications in biotechnology and medicine. We present in this paper what might be dubbed a “computational experiment” on the Dsup-DNA system. By means of molecular modelling, calculations of electrostatic potentials and electric fields, and all-atom molecular dynamics simulations, we obtained a dynamic picture of the Dsup-DNA interaction. Our results suggest that the protein is intrinsically disordered, which enables Dsup to adjust its structure to fit DNA shape. Strong electrostatic attractions and high protein flexibility drive the formation of a molecular aggregate in which Dsup shields DNA. While the precise mechanism of DNA protection conferred by Dsup remains to be elucidated, our study provides some molecular clues of their association that could be of interest for further investigation in this line.

Paraules clau

AnimalsBindingBiologyComputational biologyDamageDnaDna damageIntrinsic disorderMolecular dynamics simulationMolecular-dynamicsParticleProtein bindingProteinsRadiation toleranceSpaceStatic electricitySystemTardigradaTaxonomy

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Scientific Reports a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 17/72, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Multidisciplinary Sciences.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 4.34, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Jul 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-07-21, el següent nombre de cites:

  • WoS: 1
  • Scopus: 23
  • Google Scholar: 31

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-21:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 88.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 92 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 153.95.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 78 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a Viquipèdia: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 9 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Mínguez-Toral M) i Últim Autor (Pacios LF).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Pacios LF.