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Análisis de autorías institucional

Fernandez Pacios, LuisAutor o CoautorCuevas-Zuviría BAutor o CoautorGarrido-Arandia MAutor o Coautor

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A computational structural study on the DNA-protecting role of the tardigrade-unique Dsup protein

Publicado en:Scientific Reports. 10 (1): 13424- - 2020-12-01 10(1), DOI: 10.1038/s41598-020-70431-1

Autores: Mínguez-Toral M; Cuevas-Zuviría B; Garrido-Arandia M; Pacios LF

Afiliaciones

Resumen

© 2020, The Author(s). The remarkable ability of tardigrades to withstand a wide range of physical and chemical extremes has attracted a considerable interest in these small invertebrates, with a particular focus on the protective roles of proteins expressed during such conditions. The discovery that a tardigrade-unique protein named Dsup (damage suppressor) protects DNA from damage produced by radiation and radicals, has raised expectations concerning its potential applications in biotechnology and medicine. We present in this paper what might be dubbed a “computational experiment” on the Dsup-DNA system. By means of molecular modelling, calculations of electrostatic potentials and electric fields, and all-atom molecular dynamics simulations, we obtained a dynamic picture of the Dsup-DNA interaction. Our results suggest that the protein is intrinsically disordered, which enables Dsup to adjust its structure to fit DNA shape. Strong electrostatic attractions and high protein flexibility drive the formation of a molecular aggregate in which Dsup shields DNA. While the precise mechanism of DNA protection conferred by Dsup remains to be elucidated, our study provides some molecular clues of their association that could be of interest for further investigation in this line.

Palabras clave

AnimalsBindingBiologyComputational biologyDamageDnaDna damageIntrinsic disorderMolecular dynamics simulationMolecular-dynamicsParticleProtein bindingProteinsRadiation toleranceSpaceStatic electricitySystemTardigradaTaxonomy

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Scientific Reports debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 17/72, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 4.07, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-02, el siguiente número de citas:

  • WoS: 1
  • Scopus: 22
  • Google Scholar: 31
  • OpenCitations: 30

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 91.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 90 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 155.628.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 78 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Mínguez-Toral M) y Último Autor (Pacios LF).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Pacios LF.