{rfName}
Mo

Llicència i ús

Altmetrics

Grant support

We acknowledge Gergely Molnar for critical reading of the manuscript, Alexander Johnson for language editing and Yulija Salanenka for technical assistance. Work in the Benkova laboratory was supported by the Austrian Science Fund (FWF01_I1774S) to KO, RA and EB. Work in the Benkova laboratory was supported by the Austrian Science Fund (FWF01_I1774S) to KO, RA and EB and by the DOC Fellowship Programme of the Austrian Academy of Sciences (25008) to C.A. Work in the Wabnik laboratory was supported by the Programa de Atraccion de Talento 2017 (Comunidad de Madrid, 2017-T1/BIO-5654 to K.W.), Severo Ochoa Programme for Centres of Excellence in R&D from the Agencia Estatal de Investigacion of Spain (grant SEV-2016-0672 (2017-2021) to K.W. via the CBGP) and Programa Estatal de Generacion del Conocimiento y Fortalecimiento Cientifico y Tecnologico del Sistema de I+D+I 2019 (PGC2018-093387-A-I00) from MICIU (to K.W.). M.M. was supported by a postdoctoral contract associated to SEV-2016-0672. We acknowledge the Bioimaging Facility in IST-Austria and the Advanced Microscopy Facility of the Vienna BioCenter Core Facilities, member of the Vienna BioCenter Austria, for use of the OMX v4 3D SIM microscope. AJ was supported by the Austrian Science Fund (FWF): I03630 to J.F.

Anàlisi d'autories institucional

Marconi, MAutor o coautorWabnik, KAutor (correspondència)

Compartir

10 dejuny de 2021
Publicacions
>
Article
No

Modulation of plant root growth by nitrogen source-defined regulation of polar auxin transport

Publicat a:Embo Journal. 40 (3): e106862- - 2021-02-01 40(3), DOI: 10.15252/embj.2020106862

Autors: Otvos, Krisztina; Marconi, Marco; Vega, Andrea; O'Brien, Jose; Johnson, Alexander; Abualia, Rashed; Antonielli, Livio; Montesinos, Juan Carlos; Zhang, Yuzhou; Tan, Shutang; Cuesta, Candela; Artner, Christina; Bouguyon, Eleonore; Gojon, Alain; Friml, Jiri; Gutierrez, Rodrigo A.; Wabnik, Krzysztof; Benkova, Eva;

Afiliacions

‎ AIT Austrian Inst Technol GmbH, Bioresources Unit, Ctr Hlth & Bioresources, Tulln, Austria - Autor o coautor
‎ IST Austria, Klosterneuburg, Austria - Autor o coautor
‎ Pontificia Univ Catolica Chile, Santiago, Chile - Autor o coautor
‎ Univ Montpellier, BPMP, CNRS, INRAE,Inst Agro, Montpellier, France - Autor o coautor
‎ Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genom Plantas CBGP, UPM INIA, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Madrid, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Availability of the essential macronutrient nitrogen in soil plays a critical role in plant growth, development, and impacts agricultural productivity. Plants have evolved different strategies for sensing and responding to heterogeneous nitrogen distribution. Modulation of root system architecture, including primary root growth and branching, is among the most essential plant adaptions to ensure adequate nitrogen acquisition. However, the immediate molecular pathways coordinating the adjustment of root growth in response to distinct nitrogen sources, such as nitrate or ammonium, are poorly understood. Here, we show that growth as manifested by cell division and elongation is synchronized by coordinated auxin flux between two adjacent outer tissue layers of the root. This coordination is achieved by nitrate-dependent dephosphorylation of the PIN2 auxin efflux carrier at a previously uncharacterized phosphorylation site, leading to subsequent PIN2 lateralization and thereby regulating auxin flow between adjacent tissues. A dynamic computer model based on our experimental data successfully recapitulates experimental observations. Our study provides mechanistic insights broadening our understanding of root growth mechanisms in dynamic environments.

Paraules clau

AmmoniaApical meristemArabidopsisArabidopsis proteinArabidopsis proteinsArticleAuxinAuxin transportBiological transportCell countCell differentiationCell divisionCell elongationCell membraneCell transportCell-divisionControlled studyEndodermisFrameworkGrowth inhibitionGrowth, development and agingIndoleacetic acid derivativeIndoleacetic acidsMetabolismNitrateNitrogenNonhumanNutrientsPhosphorylationPin2Pin2 protein, arabidopsisPlant epidermis cellPlant rootPlant rootsPost&#8208Post-translational modificationPriority journalProtein dephosphorylationProtein localizationProtein traffickingProteinsR packageRoot cortex cellRoot developmentRoot growthRoot lengthSignalSystem architectureTraffickingTranslational modificationTransport at the cellular level

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Embo Journal a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició 18/297, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.76. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 4 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 15.1 (font consultada: Dimensions Jul 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-07-24, el següent nombre de cites:

  • WoS: 34
  • Scopus: 70
  • Google Scholar: 14

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-24:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 124.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 126 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 140.4.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 54 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 14 (Altmetric).

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Austria; Chile; France.

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat WABNIK, KRZYSZTOF.