{rfName}
IM

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

18

Altmetrics

Article has an altmetric score of 8

Anàlisi d'autories institucional

Song TAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

IMGG: Integrating Multiple Single-Cell Datasets through Connected Graphs and Generative Adversarial Networks

Publicat a:International Journal Of Molecular Sciences. 23 (4): 2082- - 2022-02-01 23(4), DOI: 10.3390/ijms23042082

Autors: Wang, Xun; Zhang, Chaogang; Zhang, Ying; Meng, Xiangyu; Zhang, Zhiyuan; Shi, Xin; Song, Tao

Afiliacions

Resum

There is a strong need to eliminate batch-specific differences when integrating single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) datasets generated under different experimental conditions for downstream task analysis. Existing batch correction methods usually transform different batches of cells into one preselected “anchor” batch or a low-dimensional embedding space, and cannot take full advantage of useful information from multiple sources. We present a novel framework, called IMGG, i.e., integrating multiple single-cell datasets through connected graphs and generative adversarial networks (GAN) to eliminate nonbiological differences between different batches. Compared with current methods, IMGG shows excellent performance on a variety of evaluation metrics, and the IMGG-corrected gene expression data incorporate features from multiple batches, allowing for downstream tasks such as differential gene expression analysis.

Paraules clau

Batch effectConnected graphsDeep learningGanScrna-seq

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista International Journal Of Molecular Sciences a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició 66/285, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemistry & Molecular Biology.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 2.77, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-01, el següent nombre de cites:

  • WoS: 8
  • Scopus: 10
  • OpenCitations: 10

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-01:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 18.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 18 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 7.346.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: China.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Últim Autor (SONG, TAO).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat SONG, TAO.