DNA hypomethylation of the host tree impairs interaction with mutualistic ectomycorrhizal fungus
Publicado en:New Phytologist. 238 (6): 2561-2577 - 2023-06-01 238(6), DOI: 10.1111/nph.18734
Autores: Vigneaud, J; Kohler, A; Sow, MD; Delaunay, A; Fauchery, L; Guinet, F; Daviaud, C; Barry, KW; Keymanesh, K; Johnson, J; Singan, V; Grigoriev, I; Fichot, R; Conde, D; Perales, M; Tost, J; Martin, FM; Allona, I; Strauss, SH; Veneault-Fourrey, C; Maury, S
Afiliaciones
Resumen
Ectomycorrhizas are an intrinsic component of tree nutrition and responses to environmental variations. How epigenetic mechanisms might regulate these mutualistic interactions is unknown. By manipulating the level of expression of the chromatin remodeler DECREASE IN DNA METHYLATION 1 (DDM1) and two demethylases DEMETER-LIKE (DML) in Populus tremula × Populus alba lines, we examined how host DNA methylation modulates multiple parameters of the responses to root colonization with the mutualistic fungus Laccaria bicolor. We compared the ectomycorrhizas formed between transgenic and wild-type (WT) trees and analyzed their methylomes and transcriptomes. The poplar lines displaying lower mycorrhiza formation rate corresponded to hypomethylated overexpressing DML or RNAi-ddm1 lines. We found 86 genes and 288 transposable elements (TEs) differentially methylated between WT and hypomethylated lines (common to both OX-dml and RNAi-ddm1) and 120 genes/1441 TEs in the fungal genome suggesting a host-induced remodeling of the fungal methylome. Hypomethylated poplar lines displayed 205 differentially expressed genes (cis and trans effects) in common with 17 being differentially methylated (cis). Our findings suggest a central role of host and fungal DNA methylation in the ability to form ectomycorrhizas including not only poplar genes involved in root initiation, ethylene and jasmonate-mediated pathways, and immune response but also terpenoid metabolism.
Palabras clave
Indicios de calidad
Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión
El trabajo ha sido publicado en la revista New Phytologist debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 11/265, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.
Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.49. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)
Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:
- Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 2.5 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
- Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 7.38 (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)
De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-21, el siguiente número de citas:
- WoS: 12
- Scopus: 13
- Google Scholar: 7
Impacto y visibilidad social
Análisis de liderazgo de los autores institucionales
Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: France; United States of America.