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17 de julio de 2023
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Artículo

Location and Concentration of Aromatic-Rich Segments Dictates the Percolating Inter-Molecular Network and Viscoelastic Properties of Ageing Condensates

Publicado en: Advanced Science. 10 (25): 2207742- - 2023-09-01 10(25), DOI: 10.1002/advs.202207742

Autores:

Blazquez, S; Sanchez-Burgos, I; Ramirez, J; Higginbotham, T; Conde, MM; Collepardo-Guevara, R; Tejedor, AR; Espinosa, JR
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Afiliaciones

Department of Physics - Autor o Coautor
Department of Physics , Universidad Complutense de Madrid - Autor o Coautor
Department of Physics , Universidad Politécnica de Madrid - Autor o Coautor
Department of Physics , University of Cambridge - Autor o Coautor
Univ Cambridge, Dept Genet, Cambridge CB2 3EH, Cambs, England - Autor o Coautor
Univ Cambridge, Maxwell Ctr, Dept Phys, Cavendish Lab, JJ Thomson Ave, Cambridge CB3 0HE, Cambs, England - Autor o Coautor
Univ Cambridge, Yusuf Hamied Dept Chem, Lensfield Rd, Cambridge CB2 1EW, Cambs, England - Autor o Coautor
Univ Complutense Madrid, Dept Phys Chem, Ave Complutense S-N, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Dept Chem Engn, Jose Gutierrez Abascal 2, Madrid 28006, Spain - Autor o Coautor
Universidad Politécnica de Madrid - Autor o Coautor
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Resumen

Maturation of functional liquid-like biomolecular condensates into solid-like aggregates has been linked to the onset of several neurodegenerative disorders. Low-complexity aromatic-rich kinked segments (LARKS) contained in numerous RNA-binding proteins can promote aggregation by forming inter-protein β-sheet fibrils that accumulate over time and ultimately drive the liquid-to-solid transition of the condensates. Here, atomistic molecular dynamics simulations are combined with sequence-dependent coarse-grained models of various resolutions to investigate the role of LARKS abundance and position within the amino acid sequence in the maturation of condensates. Remarkably, proteins with tail-located LARKS display much higher viscosity over time than those in which the LARKS are placed toward the center. Yet, at very long timescales, proteins with a single LARKS—independently of its location—can still relax and form high viscous liquid condensates. However, phase-separated condensates of proteins containing two or more LARKS become kinetically trapped due to the formation of percolated β-sheet networks that display gel-like behavior. Furthermore, as a work case example, they demonstrate how shifting the location of the LARKS-containing low-complexity domain of FUS protein toward its center effectively precludes the accumulation of β-sheet fibrils in FUS-RNA condensates, maintaining functional liquid-like behavior without ageing.
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Palabras clave

aggregationbeta-sheet foldingcondensate ageingdropletsdynamicsfusgranulesliquid-liquid phase separationproteinprotein aggregationrnastresstdp-43Computer simulationsCondensate ageingLiquid-liquid phase separationLiquid-phase-separationProtein aggregationRna-binding proteinsΒ-sheet folding

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Advanced Science debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 29/439, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Materials Science, Multidisciplinary. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.74. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 2.6 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-26, el siguiente número de citas:

  • WoS: 24
  • Scopus: 19
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-26:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 22.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 22 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 34.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 2 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 4 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/92519/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 41
  • Descargas: 23
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: United Kingdom.

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Tejedor Reyes, Andres.

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