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Babalola BmAutor o Coautor

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28 de agosto de 2023
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Artículo
Sí

Carrot populations in France and Spain host a complex virome rich in previously uncharacterized viruses

Publicado en: PLOS ONE. 18 (8 August): e0290108- - 2023-08-16 18(8 August), DOI: 10.1371/journal.pone.0290108

Autores:

Schönegger, D; Marais, A; Babalola, BM; Faure, C; Lefebvre, M; Svanella-Dumas, L; Brázdová, S; Candresse, T
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Afiliaciones

Czech Acad Sci, Inst Plant Mol Biol, Biol Ctr, Dept Plant Virol, Ceske Budejovice, Czech Republic - Autor o Coautor
ETSI Agron Alimentaria & Biosistemas, Campus Montegancedo, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Bordeaux, INRAE, UMR 1332 Biol Fruit & Pathol, Villenave Dornon, France - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genom Plantas CBGP, Campus Montegancedo, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Universidad Politécnica de Madrid - Autor o Coautor
Universite de Bordeaux - Autor o Coautor
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Resumen

High-throughput sequencing (HTS) has proven a powerful tool to uncover the virome of cultivated and wild plants and offers the opportunity to study virus movements across the agroecological interface. The carrot model consisting of cultivated (Daucus carota ssp. sativus) and wild carrot (Daucus carota ssp. carota) populations, is particularly interesting with respect to comparisons of virus communities due to the low genetic barrier to virus flow since both population types belong to the same plant species. Using a highly purified double-stranded RNA-based HTS approach, we analyzed on a large scale the virome of 45 carrot populations including cultivated, wild and off-type carrots (carrots growing within the field and likely representing hybrids between cultivated and wild carrots) in France and six additional carrot populations from central Spain. Globally, we identified a very rich virome comprising 45 viruses of which 25 are novel or tentatively novel. Most of the identified novel viruses showed preferential associations with wild carrots, either occurring exclusively in wild populations or infecting only a small proportion of cultivated populations, indicating the role of wild carrots as reservoir of viral diversity. The carrot virome proved particularly rich in viruses involved in complex mutual interdependencies for aphid transmission such as poleroviruses, umbraviruses and associated satellites, which can be the basis for further investigations of synergistic or antagonistic virus-vector-host relationships.
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Palabras clave

alignmentbiodiversitydiseaseplantsproteinrnasequencetransmissionvitivirusAnthriscus strainDaucus carotaFranceSpainVirome

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista PLOS ONE debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 32/134, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.83. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.39 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-07, el siguiente número de citas:

  • WoS: 10
  • Scopus: 10
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-07:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 7.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 7 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 15 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Czech Republic; France.

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