La detección y el diagnóstico de las enfermedades bacterianas son elementos esenciales para su control, a la vez que resultan primordiales tanto para prevenir su diseminación y evitar nuevos focos, como para poder adoptar las medidas oportunas para combatir al patógeno cuando ya está presente. En este artículo se presentan los últimos avances en técnicas de detección y diagnóstico de Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap) desarrollados por nuestro equipo investigador, que han ido dirigidos a mejorar la especificidad de los protocolos, tanto para la detección específica de esta bacteria como para la identificación únicamente de bacterias vivas e infectivas. Se describen estrategias de genómica dirigidas a la selección de dianas exclusivas de Xap para los protocolos de amplificación de ácidos nucleicos y, por primera vez, la puesta a punto de una técnica de qPCR capaz de identificar células vivas dentro de una población de esta bacteria.