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This work was supported by the Spanish Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades, cofunded with FEDER funds [Project Nos. AGL2017-85563-C2-1-R and RTA2017-00061-C03-03 (INIA)] and by PROMETEO project 2017/078 (to promote excellence groups) by the Conselleria d'Educacio, Investigacio, Cultura i Esports (Generalitat Valenciana). CS is a recipient of a predoctoral fellowship from Generalitat Valenciana, cofunded by the Operational Program of the European Social Fund (FSECV 2014-2020) (Grant No. ACIF/2016/188). CM was a recipient of a postdoctoral Juan de la Cierva Formation (2014) fellowship from Spanish Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades (Grant No. FJCI-2014-19817).

Análisis de autorías institucional

Saez, CristinaAutor o Coautor

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Artículo

A Major QTL Located in Chromosome 8 of Cucurbita moschata Is Responsible for Resistance to Tomato Leaf Curl New Delhi Virus

Publicado en:Frontiers In Plant Science. 11 207- - 2020-03-20 11(), DOI: 10.3389/fpls.2020.00207

Autores: Saez, Cristina; Martinez, Cecilia; Montero-Pau, Javier; Esteras, Cristina; Sifres, Alicia; Blanca, Jose; Ferriol, Maria; Lopez, Carmelo; Pico, Belen

Afiliaciones

Resumen

Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) is a bipartite whitefly transmitted begomovirus, responsible since 2013 of severe damages in cucurbit crops in Southeastern Spain. Zucchini (Cucurbita pepo) is the most affected species, but melon (Cucumis melo) and cucumber (Cucumis sativus) are also highly damaged by the infection. The virus has spread across Mediterranean basin and European countries, and integrated control measures are not being enough to reduce economic losses. The identification of resistance genes is required to develop resistant cultivars. In this assay, we studied the inheritance of the resistance to ToLCNDV previously identified in two Cucurbita moschata accessions. We generated segregating populations crossing both resistant pumpkins, an American improved cultivar Large Cheese (PI 604506) and an Indian landrace (PI 381814), with a susceptible C. moschata genotype (PI 419083). The analysis of symptoms and viral titers of all populations established the same monogenic recessive genetic control in both resistant accessions, and the allelism tests suggest the occurrence of alleles of the same locus. By genotyping with a single nucleotide polymorphism (SNP) collection evenly distributed along the C. moschata genome, a major quantitative trait locus (QTL) was identified in chromosome 8 controlling resistance to ToLCNDV. This major QTL was also confirmed in the interspecific C. moschata x C. pepo segregating populations, although C. pepo genetic background affected the resistance level. Molecular markers here identified, linked to the ToLCNDV resistance locus, are highly valuable for zucchini breeding programs, allowing the selection of improved commercial materials. The duplication of the candidate region within the C. moschata genome was studied, and genes with paralogs or single-copy genes were identified. Its synteny with the region of chromosome 17 of the susceptible C. pepo revealed an INDEL including interesting candidate genes. The chromosome 8 candidate region of C. moschata was also syntenic to the region in chromosome 11 of melon, previously described as responsible of ToLCNDV resistance. Common genes in the candidate regions of both cucurbits, with high- or moderate-impact polymorphic SNPs between resistant and susceptible C. moschata accessions, are interesting to study the mechanisms involved in this recessive resistance.

Palabras clave

1st reportBipartite begomovirusCucurbitaDiseaseGenomeIdentificatioInfecting zucchiniLuffa-cylindricaQtlRecessive resistanceResistanceSequenceSyntenSyntenyTolcndvYellow mosaic-virusZucchini

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Frontiers In Plant Science debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 17/235, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.55. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 2.18 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 7.47 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-07, el siguiente número de citas:

  • WoS: 29
  • Scopus: 37
  • Europe PMC: 15
  • OpenCitations: 31

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-07:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 61.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 61 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 5.55.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 8 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (SAEZ SANCHEZ, CRISTINA) .