{rfName}
Id

Indexado en

Licencia y uso

Icono OpenAccess

Citaciones

5

Altmetrics

Article has an altmetric score of 12

Grant support

This research was supported by funding from Qatar Foundation to Weill Cornell Medicine in Qatar through the BMRP2 Grant.

Análisis de autorías institucional

Aleksic, JovanaAutor o Coautor

Compartir

Publicaciones
>
Artículo

Identifying novel interactions of the colon-cancer related APC protein with Wnt-pathway nuclear transcription factors

Publicado en:Cancer Cell International. 22 (1): 376- - 2022-12-01 22(1), DOI: 10.1186/s12935-022-02799-1

Autores: Al-Thani, Nayra M; Schaefer-Ramadan, Stephanie; Aleksic, Jovana; Mohamoud, Yasmin A; Malek, Joel A

Afiliaciones

Resumen

BackgroundColon cancer is often driven by mutations of the adenomatous polyposis coli (APC) gene, an essential tumor suppressor gene of the Wnt beta-catenin signaling pathway. APC and its cytoplasmic interactions have been well studied. However, various groups have also observed its presence in the nucleus. Identifying novel interactions of APC in the Wnt pathway will provide an opportunity to understand APC's nuclear role better and ultimately identify potential cancer treatment targets. MethodsWe used the all-vs-all sequencing (AVA-Seq) method to interrogate the interactome of protein fragments spanning most of the 60 Wnt beta-catenin pathway proteins. Using protein fragments identified the interacting regions between the proteins with more resolution than a full-length protein approach. Pull-down assays were used to validate a subset of these interactions. Results74 known and 703 novel Wnt beta-catenin pathway protein-protein interactions were recovered in this study. There were 8 known and 31 novel APC protein-protein interactions. Novel interactions of APC and nuclear transcription factors TCF7, JUN, FOSL1, and SOX17 were particularly interesting and confirmed in validation assays. ConclusionBased on our findings of novel interactions between APC and transcription factors and previous evidence of APC localizing to the nucleus, we suggest APC may compete and repress CTNNB1. This would occur through APC binding to the transcription factors (JUN, FOSL1, TCF7) to regulate the Wnt signaling pathway including through enhanced marking of CTNNB1 for degradation in the nucleus by APC binding with SOX17. Additional novel Wnt beta-catenin pathway protein-protein interactions from this study could lead researchers to novel drug designs for cancer.

Palabras clave

Adenomatous polyposis coliAdenomatous polyposis-coliApcBeta-cateninC-junCancerCell-cycle progressionCreb binding-proteinGene promoteGsk-3-beta-dependent phosphorylationNovel protein interactionPpiPpisProtein interactionsSignaling pathwayTranscription factorsTumor-suppressorWnt signaling pathwayWnt/beta-catenin

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Cancer Cell International debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2022, se encontraba en la posición 59/241, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Oncology.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 1.52, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions May 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-05-31, el siguiente número de citas:

  • WoS: 2
  • Scopus: 2
  • Europe PMC: 1
  • OpenCitations: 3

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-05-31:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 10.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 10 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.6.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Qatar.