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Rodriguez-Paton, AlfonsoAutor o Coautor

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9 de junio de 2019
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Artículo

Sensitivity analysis of Repast computational ecology models with R/Repast

Publicado en: Ecology and Evolution. 6 (24): 8811-8831 - 2016-12-01 6(24), DOI: 10.1002/ece3.2580

Autores:

García, AP; Rodríguez-Patón, A
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Afiliaciones

Univ Politecn Madrid, Dept Inteligencia Artificial - Autor o Coautor

Resumen

Computational ecology is an emerging interdisciplinary discipline founded mainly on modeling and simulation methods for studying ecological systems. Among the existing modeling formalisms, the individual-based modeling is particularly well suited for capturing the complex temporal and spatial dynamics as well as the nonlinearities arising in ecosystems, communities, or populations due to individual variability. In addition, being a bottom-up approach, it is useful for providing new insights on the local mechanisms which are generating some observed global dynamics. Of course, no conclusions about model results could be taken seriously if they are based on a single model execution and they are not analyzed carefully. Therefore, a sound methodology should always be used for underpinning the interpretation of model results. The sensitivity analysis is a methodology for quantitatively assessing the effect of input uncertainty in the simulation output which should be incorporated compulsorily to every work based on in-silico experimental setup. In this article, we present R/Repast a GNU R package for running and analyzing Repast Simphony models accompanied by two worked examples on how to perform global sensitivity analysis and how to interpret the results.
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Palabras clave

computational ecologyindividual?based modelingrepastsensitivity analysisBacterial-populationsComputational ecologyConjugationDesignIndividual-based modelingIndividual‐based modelingPlasmidProtocolRepastSensitivity analysisSimulationSystemsSystems biology

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Ecology and Evolution debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2016, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Nature and Landscape Conservation. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-25:

  • WoS: 3
  • Scopus: 3
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-25:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 45.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 45 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 1.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/45441/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 441
  • Descargas: 414
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (PRESTES GARCIA, ANTONIO) y Último Autor (RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido PRESTES GARCIA, ANTONIO.

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Reconocimientos ligados al ítem

European FP7-ICT-FET EU Research Project, Grant/Award Number: 612146; Spanish Government (MINECO), Grant/Award Number: TIN2012-36992
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