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Martinez, ManuelAutor (correspondencia)

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29 de enero de 2014
Publicaciones
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Review

Plant protein-coding gene families: emerging bioinformatics approaches

Publicado en: TRENDS IN PLANT SCIENCE. 16 (10): 558-567 - 2011-10-01 16(10), DOI: 10.1016/j.tplants.2011.06.003

Autores:

Martinez, M
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Afiliaciones

- Autor o Coautor
Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas (UPM-INIA), Campus Montegancedo, Universidad Politécnica de Madrid. Autovía M40 (Km 38), 28223-Pozuelo de Alarcón, Madrid, Spain. m.martinez@upm.es - Autor o Coautor

Resumen

Protein-coding gene families are sets of similar genes with a shared evolutionary origin and, generally, with similar biological functions. In plants, the size and role of gene families has been only partially addressed. However, suitable bioinformatics tools are being developed to cluster the enormous number of sequences currently available in databases. Specifically, comparative genomic databases promise to become powerful tools for gene family annotation in plant clades. In this review, I evaluate the data retrieved from various gene family databases, the ease with which they can be extracted and how useful the extracted information is.Copyright © 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
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Palabras clave

AnalysisArabidopsisArabidopsis-thalianaComparative phylogenetic analysisComputational biologyCystatinsCysteine proteinasesDatabaseDatabases, geneticEvolutionExpressionGenes, plantGenomeGenomicsInternetMultigene familyRiceTranscription factors

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista TRENDS IN PLANT SCIENCE debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2011, se encontraba en la posición 2/190, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-24:

  • WoS: 29
  • Scopus: 32
  • Europe PMC: 18
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-24:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 145.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 145 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 2.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 3 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/11347/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 468
  • Descargas: 1,359
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: England.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (MARTINEZ MUÑOZ, MANUEL) y Último Autor (MARTINEZ MUÑOZ, MANUEL).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido MARTINEZ MUÑOZ, MANUEL.

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