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Investigadores/as Institucionales

Fernandez-Calvo, PatriciaAutor o Coautor

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13 de enero de 2020
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Artículo
Sí

The JA-pathway MYC transcription factors regulate photomorphogenic responses by targeting HY5 gene expression

Publicado en: Plant Journal. 102 (1): 138-152 - 2020-04-01 102(1), DOI: 10.1111/tpj.14618

Autores:

Ortigosa, Andres; Fonseca, Sandra; Franco-Zorrilla, Jose M.; Fernandez-Calvo, Patricia; Zander, Mark; Lewsey, Mathew G.; Garcia-Casado, Gloria; Fernandez-Barbero, Gemma; Ecker, Joseph R.; Solano, Roberto;
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Afiliaciones

CSIC, CNB, Dept Plant Mol Genet, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
CSIC, CNB, Genom Unit, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
La Trobe Univ, Ctr AgriBiosci, Australian Res Council Res Hub Med Agr, AgriBio Bldg, Bundoora, Vic 3086, Australia - Autor o Coautor
La Trobe Univ, Dept Anim Plant & Soil Sci, AgriBio Bldg, Bundoora, Vic 3086, Australia - Autor o Coautor
Salk Inst Biol Studies, Howard Hughes Med Inst, La Jolla, CA 92037 USA - Autor o Coautor
Salk Inst Biol Studies, Plant Biol Lab, La Jolla, CA 92037 USA - Autor o Coautor
UPM, INIA, CBGP, Madrid, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Jasmonates are key regulators of the balance between defence and growth in plants. However, the molecular mechanisms by which activation of defence reduces growth are not yet fully understood. Here, we analyze the role of MYC transcription factors (TFs) and jasmonic acid (JA) in photomorphogenic growth. We found that multiple myc mutants share light-associated phenotypes with mutants of the phytochrome B photoreceptor, such as delayed seed germination in the dark and long hypocotyl growth. Overexpression of MYC2 in a phyB background partially suppressed its long hypocotyl phenotype. Transcriptomic analysis of multiple myc mutants confirmed that MYCs are required for full expression of red (R) light-regulated genes, including the master regulator HY5. ChIP-seq analyses revealed that MYC2 and MYC3 bind directly to the promoter of HY5 and that HY5 gene expression and protein levels are compromised in multiple myc mutants. Altogether, our results pinpoint MYCs as photomorphogenic TFs that control phytochrome responses by activating HY5 expression. This has important implications in understanding the trade-off between growth and defence as the same TFs that activate defence responses are photomorphogenic growth regulators.
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Palabras clave

arabidopsisdefencehy5jasmonatelight signallingmycArabidopsisArabidopsis-thalianaBioconductor packageChip-seqDefenceDefenseDna-binding specificitiesHy5JasmonateLightLight signallingMycPhytochrome-aPlant-growthSeed-germinationTrade-off

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plant Journal debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 15/235, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales de Scopus Elsevier, arroja un valor para la media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 3.35, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-12-20, el siguiente número de citas:

  • WoS: 18
  • Scopus: 57
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-12-20:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 69.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 69 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 7.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 2 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 11 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Australia; United States of America.

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Reconocimientos ligados al ítem

We thank Daoxin Xie (Tsinghua University) for providing mycT b and mycQ seeds and Vicente Rubio (CNB-CSIC) for sharing anti-HY5 (Santa Cruz Biotechnology). We also thank Vicente Rubio, Christian Fankhauser, and members of the Solano laboratory for critical reading of the manuscript. Research in RS's laboratory was funded by the Spanish Ministry for Science and Innovation grant BIO2016-77216-R (MINECO/FEDER). Research in JMF's laboratory was funded by the Spanish Ministry for Science and Innovation grant BIO2017-86651-P (MINECO/FEDER). Work in JRE's laboratory is funded by the Gordon and Betty Moore Foundation (3034) and the National Science Foundation (MCB-1024999). JRE is an investigator of the Howard Hughes Medical Institute. AO was supported by a 'Severo Ochoa' CNB PhD fellowship. M.Z. was supported by the Salk Pioneer Postdoctoral Endowment Fund as well as by a Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) research fellowship (Za-730/1-1). MGL was funded by a EU Marie Curie FP7 International Outgoing Fellowship (252475).
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