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Sopena-Torres, SaraAutor (correspondencia)Lopez, GemmaAutor o CoautorDel Hierro, IreneAutor o CoautorDiaz-Gonzalez, SandraAutor o CoautorGonzalez-Melendi, PabloAutor o CoautorMelida, HugoAutor o CoautorMartin-Dacal, MarinaAutor o CoautorSacristan, SoledadAutor (correspondencia)Molina, AntonioAutor (correspondencia)

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1 de enero de 2021
Publicaciones
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Artículo
Bronze

Differential Expression of Fungal Genes Determines the Lifestyle of Plectosphaerella Strains During Arabidopsis thaliana Colonization

Publicado en: MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS. 33 (11): 1299-1314 - 2020-11-01 33(11), DOI: 10.1094/MPMI-03-20-0057-R

Autores:

Munoz-Barrios, Antonio; Sopena-Torres, Sara; Ramos, Brisa; Lopez, Gemma; del Hierro, Irene; Diaz-Gonzalez, Sandra; Gonzalez-Melendi, Pablo; Melida, Hugo; Fernandez-Calleja, Vanessa; Mixao, Veronica; Martin-Dacal, Marina; Marcet-Houben, Marina; Gabaldon, Toni; Sacristan, Soledad; Molina, Antonio
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Afiliaciones

Barcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat CRG, Dr Aiguader 88, Barcelona 08003, Spain - Autor o Coautor
Barcelona Supercomp Ctr, Jordi Girona 29, Barcelona 08034, Spain - Autor o Coautor
ICREA, Pg Lluis Companys 23, Barcelona 08010, Spain - Autor o Coautor
Inst Res Biomed, Jordi Girona 29, Barcelona 08034, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Campus Montegancedo UPM, Pozuelo De Alarcon 28223, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Dept Biotecnol Biol Vegetal, Escuela Tecn Super Ingn Agron Alimentaria & Biosi, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
Univ Pompeu Fabra UPF, Barcelona 08003, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

The fungal genus Plectosphaerella comprises species and strains with different lifestyles on plants, such as P cucumerina, which has served as model for the characterization of Arabidopsis thaliana basal and nonhost resistance to necrotrophic fungi. We have sequenced, annotated, and compared the genomes and transcriptomes of three Plectosphaerella strains with different lifestyles on A. thaliana, namely, PcBMM, a natural pathogen of wild-type plants (Col-0), Pc2127, a nonpathogenic strain on Col-0 but pathogenic on the immunocompromised cyp79B2 cyp79B3 mutant, and P0831, which was isolated from a natural population of A. thaliana and is shown here to be nonpathogenic and to grow epiphytically on Col-0 and cyp79B2 cyp79B3 plants. The genomes of these Plectosphaerella strains are very similar and do not differ in the number of genes with pathogenesis-related functions, with the exception of secreted carbohydrate-active enzymes (CAZymes), which are up to five times more abundant in the pathogenic strain PcBMM. Analysis of the fungal transcriptomes in inoculated Col-0 and cyp79B2 cyp79B3 plants at initial colonization stages confirm the key role of secreted CAZymes in the necrotrophic interaction, since PcBMM expresses more genes encoding secreted CAZymes than Pc2127 and P0831. We also show that P0831 epiphytic growth on A. thaliana involves the transcription of specific repertoires of fungal genes, which might be necessary for epiphytic growth adaptation. Overall, these results suggest that in-planta expression of specific sets of fungal genes at early stages of colonization determine the diverse lifestyles and pathogenicity of Plectosphaerella strains.
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Palabras clave

Analysis toolkitArabidopsisAscomycotaCarbohydrate-active enzymesCazymeEndophytic fungiEpiphytic fungusGenes, fungalGenomeHeterotrimeric g-proteinImmunityMultiple sequence alignmentNecrotrophNonhost resistancePathogenicityPlant diseasesPlectosphaerellaPlectosporium-tabacinumReceptor-like kinaseWall-degrading enzymes

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 37/235, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-26:

  • Google Scholar: 8
  • WoS: 10
  • Scopus: 11
  • Europe PMC: 6
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-26:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 28.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 28 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 19 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/87264/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 128
  • Descargas: 19
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Munoz-Barrios, Antonio) y Último Autor (MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido SOPEÑA TORRES, SARA, Ramos, Brisa, SACRISTAN BENAYAS, SOLEDAD y MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO.

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Reconocimientos ligados al ítem

This work was supported by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (MINECO) grant BIO2015-64077-R and the Spanish Research Agency (AEI) grant RTI2018-096975-B-I00 to A. Molina and by the Severo Ochoa Programme for Centers of Excellence in R&D grant SEV-2016-0672 (2017-2021) to the CBGP (UPM-INIA). In the frame of SEV-2016-0672 program, H. Melida was supported with a postdoctoral contract. A. Munoz-Barrios was financially supported by the Universidad Politecnica de Madrid (UPM) Ph.D. students PIF program, I. del Hierro was a FPU fellow (Spanish Ministry of Education, Culture and Sports grant FPU16/07118), V. Fernandez-Calleja was supported by the Consejeria de Educacion e Investigacion of Comunidad de Madrid YEI program for postdoctoral researchers (PEJD-2016/BIO-3327), and the work was further supported through a Comunidad de Madrid YEI program for laboratory technicians grant (PEJ16/BIO/TL-1570).
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