{rfName}
DN

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

31

Altmetrics

Plum Print visual indicator of research metrics
PlumX Metrics
  • Citas
    • Índice de Citas: 12
    • Citas de Políticas: 1
  • Capturas
    • Lectores: 25
  • Menciones
    • Menciones Noticias: 2
Ver detalles
Article has an altmetric score of 30

Anàlisi d'autories institucional

Conde DAutor o coautorPerales MAutor o coautorAllona IAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

DNA hypomethylation of the host tree impairs interaction with mutualistic ectomycorrhizal fungus

Publicat a:New Phytologist. 238 (6): 2561-2577 - 2023-06-01 238(6), DOI: 10.1111/nph.18734

Autors: Vigneaud, J; Kohler, A; Sow, MD; Delaunay, A; Fauchery, L; Guinet, F; Daviaud, C; Barry, KW; Keymanesh, K; Johnson, J; Singan, V; Grigoriev, I; Fichot, R; Conde, D; Perales, M; Tost, J; Martin, FM; Allona, I; Strauss, SH; Veneault-Fourrey, C; Maury, S

Afiliacions

Centre National de Recherche en Génomique Humaine - Autor o coautor
CSIC-UPM-INIA-CBGP - Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas - Autor o coautor
CSIC-UPM-INIA-CBGP - Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas , Universidad Politécnica de Madrid - Autor o coautor
Department of Plant & Microbial Biology , U.S. Department of Energy Joint Genome Institute - Autor o coautor
Oregon State Univ, Dept Forest Ecosyst & Soc, Corvallis, OR 97331 USA - Autor o coautor
Oregon State university - Autor o coautor
U.S. Department of Energy Joint Genome Institute - Autor o coautor
Univ Calif Berkeley, Dept Plant & Microbial Biol, Berkeley, CA 94720 USA - Autor o coautor
Univ Lorraine, Ctr INRAE Grand Est Nancy, UMR 1136 Interact Arbres Microorganismes, INRAE, F-54280 Nancy, France - Autor o coautor
Univ Orleans, LBLGC, INRAE, EA USC 1207 1328, F-45067 Orleans, France - Autor o coautor
Univ Paris Saclay, Inst Biol Francois Jacob, Ctr Natl Rech Genomique Humaine, Lab Epigenet & Environm, F-91000 Evry, France - Autor o coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genomica Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr, Alimentaria INIA CSIC, Campus Montegancedo UPM, Pozuelo De Alarcon 28223, Madrid, Spain - Autor o coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Escuela Tecn Super Ingn Agron Alimentaria & Biosis, Dept Biotecnol Biol Vegetal, Madrid 28040, Spain - Autor o coautor
Universite d'Orleans - Autor o coautor
Université de Lorraine - Autor o coautor
US Dept Energy Joint Genome Inst, Lawrence Berkeley Natl Lab, Berkeley, CA 94720 USA - Autor o coautor
Veure més

Resum

Ectomycorrhizas are an intrinsic component of tree nutrition and responses to environmental variations. How epigenetic mechanisms might regulate these mutualistic interactions is unknown. By manipulating the level of expression of the chromatin remodeler DECREASE IN DNA METHYLATION 1 (DDM1) and two demethylases DEMETER-LIKE (DML) in Populus tremula × Populus alba lines, we examined how host DNA methylation modulates multiple parameters of the responses to root colonization with the mutualistic fungus Laccaria bicolor. We compared the ectomycorrhizas formed between transgenic and wild-type (WT) trees and analyzed their methylomes and transcriptomes. The poplar lines displaying lower mycorrhiza formation rate corresponded to hypomethylated overexpressing DML or RNAi-ddm1 lines. We found 86 genes and 288 transposable elements (TEs) differentially methylated between WT and hypomethylated lines (common to both OX-dml and RNAi-ddm1) and 120 genes/1441 TEs in the fungal genome suggesting a host-induced remodeling of the fungal methylome. Hypomethylated poplar lines displayed 205 differentially expressed genes (cis and trans effects) in common with 17 being differentially methylated (cis). Our findings suggest a central role of host and fungal DNA methylation in the ability to form ectomycorrhizas including not only poplar genes involved in root initiation, ethylene and jasmonate-mediated pathways, and immune response but also terpenoid metabolism.

Paraules clau
cellschromatindemeterdna demethylationeepigenomeexpressionlaccaria bicolorlaccaria-bicolormethylationmethylomemycorrhizaspigeneticpoplarDemeterDnaDna demethylationeDna methylationDna methylation 1LaccariaLaccaria bicolorMycorrhizaeMycorrhizasPigeneticPlant rootsPoplarPopulusPopulus-trichocarpaTrees

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista New Phytologist a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2023, es trobava a la posició 11/265, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 6.73, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Apr 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-04-30, el següent nombre de cites:

  • WoS: 12
  • Scopus: 12
  • Google Scholar: 7
  • OpenCitations: 12
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-04-30:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 24.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 25 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 29.05.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 25 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: France; United States of America.