{rfName}
Ac

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

30

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Pérez-MartínAutor o coautor

Compartir

3 dejuny de 2024
Publicacions
>
Article
Bronze

Activation of autophagy by metals in Chlamydomonas reinhardtii

Publicat a:Eukaryotic Cell. 14 (9): 964-973 - 2015-01-01 14(9), DOI: 10.1128/EC.00081-15

Autors: Pérez-Martín M; Blaby-Haas CE; Pérez-Pérez ME; Andrés-Garrido A; Blaby IK; Merchant SS; Crespo JL

Afiliacions

Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, Los Angeles, CA, United States - Autor o coautor
Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, Los Angeles, CA, United States, Institute for Genomics and Proteomics, University of California, Los Angeles, CA, United States - Autor o coautor
Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)-Universidad de Sevilla, Seville, Spain - Autor o coautor
M.; Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis; Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)-Universidad de Sevilla; Seville; Spain - Autor o coautor

Resum

Autophagy is an intracellular self-degradation pathway by which eukaryotic cells recycle their own material in response to specific stress conditions. Exposure to high concentrations of metals causes cell damage, although the effect of metal stress on autophagy has not been explored in photosynthetic organisms. In this study, we investigated the effect of metal excess on autophagy in the model unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii. We show in cells treated with nickel an upregulation of ATG8 that is independent of CRR1, a global regulator of copper signaling in Chlamydomonas. A similar effect on ATG8 was observed with copper and cobalt but not with cadmium or mercury ions. Transcriptome sequencing data revealed an increase in the abundance of the protein degradation machinery, including that responsible for autophagy, and a substantial overlap of that increased abundance with the hydrogen peroxide response in cells treated with nickel ions. Thus, our results indicate that metal stress triggers autophagy in Chlamydomonas and suggest that excess nickel may cause oxidative damage, which in turn activates degradative pathways, including autophagy, to clear impaired components and recover cellular homeostasis. © 2015, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.

Paraules clau

AutophagyCation transport proteinCation transport proteinsChlamydomonas reinhardtiiDrug effectsGeneticsHeavy metalMetabolismMetals, heavyOxidative stressPlant proteinPlant proteinsTranscriptome

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Eukaryotic Cell a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2015, es trobava a la posició 6/29, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Mycology.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 2.48, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Jul 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-07-20, el següent nombre de cites:

  • Scopus: 29

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-20:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 77.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 77 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 1.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 2 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: United States of America.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (PÉREZ MARTÍN, MARTA) .