{rfName}
Th

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

1

Altmetrics

Article has an altmetric score of 47

Anàlisi d'autories institucional

Jane, EAutor o coautor

Compartir

Publicacions
>
Article

The Theranostic Genome

Publicat a:Nature Communications. 15 (1): 10904- - 2024-12-30 15(1), DOI: 10.1038/s41467-024-55291-x

Autors: Xu, XY; Jané, P; Taelman, V; Jané, E; Dumont, RA; Garama, Y; Kim, F; Gómez, MD; Gariani, K; Walter, MA

Afiliacions

Geneva Univ Hosp, Div Endocrinol Diabet Nutr & Patient Therapeut Edu, Geneva - Autor o coautor
Geneva Univ Hosp, Nucl Med & Mol Imaging Div, Geneva - Autor o coautor
Univ Lucerne, Luzern - Autor o coautor
Univ Lucerne, St Anna Hosp, Luzern - Autor o coautor
Univ Politecn Madrid, ETSIAE, Dept Matemat Aplicada Ingn Aerosp, Madrid 28040, Spain; Hosp Univ Ramon & Cajal, Serv Med Nucl - Autor o coautor
Veure més

Resum

Theranostic drugs represent an emerging path to deliver on the promise of precision medicine. However, bottlenecks remain in characterizing theranostic targets, identifying theranostic lead compounds, and tailoring theranostic drugs. To overcome these bottlenecks, we present the Theranostic Genome, the part of the human genome whose expression can be utilized to combine therapeutic and diagnostic applications. Using a deep learning-based hybrid human-AI pipeline that cross-references PubMed, the Gene Expression Omnibus, DisGeNET, The Cancer Genome Atlas and the NIH Molecular Imaging and Contrast Agent Database, we bridge individual genes in human cancers with respective theranostic compounds. Cross-referencing the Theranostic Genome with RNAseq data from over 17'000 human tissues identifies theranostic targets and lead compounds for various human cancers, and allows tailoring targeted theranostics to relevant cancer subpopulations. We expect the Theranostic Genome to facilitate the development of new targeted theranostics to better diagnose, understand, treat, and monitor a variety of human cancers.

Paraules clau

(he)3 zher3(08698) dotaga in 111AblationAmino acid sequenceAmino acid substitutionArticleArtificial intelligenceBile duct carcinomaBone marrow cellCancerCancer tissueCastration resistant prostate cancerChromophobe renal cell carcinomaChx a'' dtpa dupa pep ga 68Clear cell papillary renal cell carcinomaColon adenocarcinomaControlled studyCyclooctyne dota mmpi ga 68CytoscapeDatabaseDeep learningDisease treatmentDota chce7 lu 177Dota peg antiepcam aptamer cu 64Dota rituximab lu 177Dtpa (anti hcg) in 11Dtpa anti myosin in 111Gene expressionGeneticsGenomeGenome, humanHbed cc azepin metmab ga 68HumansHynic aptedb tc 99mHynic chk tc 99mInvasive breast cancerKnowledge gapLiver cell carcinomaLung adenocarcinomaMaleMalignant neoplasmMedical subject headingsMedicineMedlineMesotheliomaMetastatic castration resistant prostate cancerMolecular imagingNatural killer cellNatural language processingNeoplasmNeoplasmsNota msa ga 68OncogenomicsPancreas adenocarcinomaPapillary renal cell carcinomaParagangliomaPeptidePersonalized cancer therapyPersonalized medicinePetPheochromocytomaPleiotropyPrecision medicinePredictionProceduresProstate adenocarcinomaProstate tissueProteomeRadioiodineRadiotracerReceptorRectal adenocarcinomaRna sequencingSarcomaSquamous cell lung carcinomaStomach adenocarcinomaTesticular germ cell tumorTheranostic nanomedicineTherapyThyroid carcinomaTracerTranscriptomeTransitional cell carcinoma of the bladderUnclassified drugUterine carcinosarcomaUterine cervix cancerUvea melanomaY chromosome

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Nature Communications a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2024 encara no hi ha indicis calculats, però el 2023, es trobava a la posició 8/134, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Multidisciplinary Sciences. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-06-14:

  • Scopus: 1

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-14:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 18.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 18 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 47.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 2 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 6 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Switzerland.