{rfName}
Ca

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Impacte en els Objectius de Desenvolupament Sostenible (ODS)

Anàlisi d'autories institucional

NuÑez Hernández, AndrésAutor o coautor

Compartir

Publicacions
>
Article

Calnexin is essential for survival under nitrogen starvation and stationary phase in Schizosaccharomyces pombe

Publicat a:Plos One. 10 (3): e0121059-e0121059 - 2015-03-24 10(3), DOI: 10.1371/journal.pone.0121059

Autors: Núñez A., Dulude D., Jbel M., Rokeach L.

Afiliacions

Resum

© 2015 Núñez et al. Cell fate is determined by the balance of conserved molecular mechanisms regulating death (apoptosis) and survival (autophagy). Autophagy is a process by which cells recycle their organelles and macromolecules through degradation within the vacuole in yeast and plants, and lysosome in metazoa. In the yeast Schizosaccharomyces pombe, autophagy is strongly induced under nitrogen starvation and in aging cells. Previously, we demonstrated that calnexin (Cnx1p), a highly conserved transmembrane chaperone of the endoplasmic reticulum (ER), regulates apoptosis under ER stress or inositol starvation. Moreover, we showed that in stationary phase, Cnx1p is cleaved into two moieties, L-Cnx1p and S-Cnx1p. Here, we show that the processing of Cnx1p is regulated by autophagy, induced by nitrogen starvation or cell aging. The cleavage of Cnx1p involves two vacuolar proteases: Isp6, which is essential for autophagy, and its paralogue Psp3. Blocking autophagy through the knockout of autophagy-related genes (atg) results in inhibition of both, the cleavage and the trafficking of Cnx1p from the ER to the vacuole. We demonstrate that Cnx1p is required for cell survival under nitrogen-starvation and in chronological aging cultures. The death of the mini-cnx1 mutant (overlapping S-cnx1p) cells is accompanied by accumulation of high levels of reactive-oxygen species (ROS), a slowdown in endocytosis and severe cell-wall defects. Moreover, mutant cells expressing only S-Cnx1p showed cell wall defects. Co-expressing mutant overlapping the L-Cnx1p and S-Cnx1p cleavage products reverses the death, ROS phenotype and cell wall defect to wild-type levels. As it is involved in both apoptosis and autophagy, Cnx1p could be a nexus for the crosstalk between these pro-death and pro-survival mechanisms. Ours, and observations in mammalian systems, suggest that the multiple roles of calnexin depend on its sub-cellular localization and on its cleavage. The use of S. pombe should assist in further shedding light on the multiple roles of calnexin.

Paraules clau

Life on land

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plos One a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2015, es trobava a la posició 11/62, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Multidisciplinary Sciences.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 1.15, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-08, el següent nombre de cites:

  • WoS: 8
  • Scopus: 12
  • Europe PMC: 4
  • Open Alex: 13
  • OpenCitations: 13

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-08:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 35.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 35 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 0.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 2 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
Seguint amb l'impacte social del treball, és important destacar el fet que, pel seu contingut, pot ser assignat a la línia d'interès de ODS 15 - Life on land, amb una probabilitat del 42% segons l'algoritme mBERT desenvolupat per Aurora University.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Canada.