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NuÑez Hernández, AndrésAutor o Coautor

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Calnexin is essential for survival under nitrogen starvation and stationary phase in Schizosaccharomyces pombe

Publicado en:Plos One. 10 (3): e0121059-e0121059 - 2015-03-24 10(3), DOI: 10.1371/journal.pone.0121059

Autores: Núñez A., Dulude D., Jbel M., Rokeach L.

Afiliaciones

Resumen

© 2015 Núñez et al. Cell fate is determined by the balance of conserved molecular mechanisms regulating death (apoptosis) and survival (autophagy). Autophagy is a process by which cells recycle their organelles and macromolecules through degradation within the vacuole in yeast and plants, and lysosome in metazoa. In the yeast Schizosaccharomyces pombe, autophagy is strongly induced under nitrogen starvation and in aging cells. Previously, we demonstrated that calnexin (Cnx1p), a highly conserved transmembrane chaperone of the endoplasmic reticulum (ER), regulates apoptosis under ER stress or inositol starvation. Moreover, we showed that in stationary phase, Cnx1p is cleaved into two moieties, L-Cnx1p and S-Cnx1p. Here, we show that the processing of Cnx1p is regulated by autophagy, induced by nitrogen starvation or cell aging. The cleavage of Cnx1p involves two vacuolar proteases: Isp6, which is essential for autophagy, and its paralogue Psp3. Blocking autophagy through the knockout of autophagy-related genes (atg) results in inhibition of both, the cleavage and the trafficking of Cnx1p from the ER to the vacuole. We demonstrate that Cnx1p is required for cell survival under nitrogen-starvation and in chronological aging cultures. The death of the mini-cnx1 mutant (overlapping S-cnx1p) cells is accompanied by accumulation of high levels of reactive-oxygen species (ROS), a slowdown in endocytosis and severe cell-wall defects. Moreover, mutant cells expressing only S-Cnx1p showed cell wall defects. Co-expressing mutant overlapping the L-Cnx1p and S-Cnx1p cleavage products reverses the death, ROS phenotype and cell wall defect to wild-type levels. As it is involved in both apoptosis and autophagy, Cnx1p could be a nexus for the crosstalk between these pro-death and pro-survival mechanisms. Ours, and observations in mammalian systems, suggest that the multiple roles of calnexin depend on its sub-cellular localization and on its cleavage. The use of S. pombe should assist in further shedding light on the multiple roles of calnexin.

Palabras clave

Life on land

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plos One debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2015, se encontraba en la posición 11/62, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 1.15, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions May 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-05-31, el siguiente número de citas:

  • WoS: 8
  • Scopus: 12
  • Europe PMC: 4
  • Open Alex: 13
  • OpenCitations: 13

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-05-31:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 35.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 35 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 0.5.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
Siguiendo con el impacto social del trabajo, es importante enfatizar el hecho de que, por su contenido, puede ser asignado a la línea de interés del ODS 15 - Life on land, con una probabilidad del 42% según el algoritmo mBERT desarrollado por Aurora University.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Canada.