Publicacions
>
Review

Reactive oxygen species (ROS) and nucleic acid modifications during seed dormancy

Publicat a:Plants-Basel. 9 (6): E679- - 2020-06-01 9(6), DOI: 10.3390/plants9060679

Autors: Katsuya-gaviria K; Caro E; Carrillo-barral N; Iglesias-fernández R

Afiliacions

Escuela Tecnica Superior de Ingenieros Agronomos de Madrid - Autor o coautor
Universidad Politécnica de Madrid - Autor o coautor
Universidade da Coruña - Autor o coautor

Resum

© 2020 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland. The seed is the propagule of higher plants and allows its dissemination and the survival of the species. Seed dormancy prevents premature germination under favourable conditions. Dormant seeds are only able to germinate in a narrow range of conditions. During after-ripening (AR), a mechanism of dormancy release, seeds gradually lose dormancy through a period of dry storage. This review is mainly focused on how chemical modifications of mRNA and genomic DNA, such as oxidation and methylation, affect gene expression during late stages of seed development, especially during dormancy. The oxidation of specific nucleotides produced by reactive oxygen species (ROS) alters the stability of the seed stored mRNAs, being finally degraded or translated into non-functional proteins. DNA methylation is a well-known epigenetic mechanism of controlling gene expression. In Arabidopsis thaliana, while there is a global increase in CHH-context methylation through embryogenesis, global DNA methylation levels remain stable during seed dormancy, decreasing when germination occurs. The biological significance of nucleic acid oxidation and methylation upon seed development is discussed.

Paraules clau

after-ripeningdna methylationoxidationrna stabilityrosseed dormancy5-methylcytosineAbaAfter-ripeningArabidopsis-thalianaDna methylationGene-expressionGerminationMessenger-rna oxidationOxidationProteinReleaseRna stabilityRosSeed dormancySeed vigourSignaling pathways

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plants-Basel a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 47/235, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 2.76, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 6.59 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-16, el següent nombre de cites:

  • WoS: 9
  • Scopus: 40
  • Europe PMC: 5
  • OpenCitations: 36

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-16:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 55.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 55 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 3.35.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 7 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Katsuya-gaviria K) i Últim Autor (IGLESIAS FERNANDEZ, RAQUEL).