{rfName}
Ch

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

4

Altmetrics

Article has an altmetric score of 5

Grant support

The research leading to these results has received funding from the Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades, Spain (grant CGL2016-75904-C2-2-P). R. Pong-Wong is funded by the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement nffi 772787 (SMARTER) and the Biotechnology and Biological Sciences Research Council through Institute Strategic Programme Grant funding (BBS/E/D/30002275).

Anàlisi d'autories institucional

Toro, MaAutor o coautor

Compartir

Publicacions
>
Article

Changes in Allele Frequencies When Different Genomic Coancestry Matrices Are Used for Maintaining Genetic Diversity

Publicat a:Genes. 12 (5): 673- - 2021-05-01 12(5), DOI: 10.3390/genes12050673

Autors: Morales-Gonzalez, Elisabeth; Fernandez, Jesus; Pong-Wong, Ricardo; Toro, Miguel Angel; Villanueva, Beatriz;

Afiliacions

‎ INIA, Dept Mejora Genet, Km 7-5, Madrid 28040, Spain - Autor o coautor
‎ Univ Edinburgh, R D SVS, Roslin EH25 9RG, Midlothian, Scotland - Autor o coautor
‎ Univ Edinburgh, Roslin Inst, Genet & Genom, Roslin EH25 9RG, Midlothian, Scotland - Autor o coautor
‎ Univ Politecn Madrid, Dept Prod Agr, Madrid 28040, Spain - Autor o coautor

Resum

A main objective in conservation programs is to maintain genetic variability. This can be achieved using the Optimal Contributions (OC) method that optimizes the contributions of candidates to the next generation by minimizing the global coancestry. However, it has been argued that maintaining allele frequencies is also important. Different genomic coancestry matrices can be used on OC and the choice of the matrix will have an impact not only on the genetic variability maintained, but also on the change in allele frequencies. The objective of this study was to evaluate, through stochastic simulations, the genetic variability maintained and the trajectory of allele frequencies when using two different genomic coancestry matrices in OC to minimize the loss of diversity: (i) the matrix based on deviations of the observed number of alleles shared between two individuals from the expected numbers under Hardy-Weinberg equilibrium (theta(LH)); and (ii) the matrix based on VanRaden's genomic relationship matrix (theta(VR)). The results indicate that the use of theta(LH) resulted in a higher genetic variability than the use of theta(VR). However, the use of theta(VR) maintained allele frequencies closer to those in the base population than the use of theta(LH).

Paraules clau

AdultAllele frequenciesAnimalAnimalsArticleBiological modelCase reportClinical articleConsanguinityConsequencesConservationDeleterious mutationsEndangered speciesFemaleGene frequencyGene linkage disequilibriumGenetic diversityGenetic fitnessGenetic polymorphismGenetic variabilityGenomic coancestry matrixHumanHuman experimentLinkage disequilibriumMaleManagementModels, geneticOptimal contributionsPedigreePhylogenyPolymorphism, geneticReproductive fitnessSelectionSimulationStochastic modelTools

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Genes a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició 72/175, aconseguint així situar-se com a revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoria Genetics & Heredity. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada en el Cuartil Q2 para la agencia Scopus (SJR) en la categoría Genetics.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 1.18, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-11, el següent nombre de cites:

  • Scopus: 4
  • OpenCitations: 4

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-11:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 8.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 8 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 4.35.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 6 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: United Kingdom.