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15 de septiembre de 2024
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Artículo
Sí

Genetic Dissection of ToLCNDV Resistance in Resistant Sources of Cucumis melo

Publicado en: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. 25 (16): 8880- - 2024-08-01 25(16), DOI: 10.3390/ijms25168880

Autores:

Pérez-Moro, C; Sáez, C; Sifres, A; Lopez, C; Dhillon, NPS; Picó, B; Pérez-de-Castro, A
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Afiliaciones

Kasetsart Univ, World Vegetable Ctr, Kamphaeng Saen 73140, Nakhon Pathom, Thailand - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Ctr Biotecnol & Genomica Plantas UPM INIA, Madrid 28031, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, ETS Ingn Agron Alimentaria & Biosistemas, Madrid 28031, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Conservac & Mejora Agrodivers Valenciana COMA, Camino Vera S-N, Valencia 46022, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) is a begomovirus causing significant melon (Cucumis melo) crop losses globally. This study aims to map the ToLCNDV resistance in the PI 414723 melon accession, previously identified and characterized through phenotypic studies, thereby exploring shared genomic regions with the established resistant source WM-7. In the present study, WM-7 and PI 414723 were crossed with the susceptible accessions 'Rochet' and 'Blanco' respectively, to generate F-1 hybrids. These hybrids were self-pollinated to generate the populations for mapping the ToLCNDV resistance region and designing markers for marker-assisted selection. Disease evaluation included visual symptom scoring, viral-load quantification and tissue printing. Genotyping-by-sequencing and SNP markers were used for quantitative trait loci (QTL) mapping. For genetic analysis, qPCR and bulked segregant RNA-seq (BSR-seq) were performed. Gene expression was assessed using RNA-seq, and qRT-PCR was used for confirmation. The research narrows the candidate region for resistance in WM-7 and identifies overlapping QTLs on chromosome 11 in PI 414723, found in the region of the DNA primase large subunit. BSR-seq and expression analyses highlight potential regulatory roles of chromosome 2 in conferring resistance. Differential expression was confirmed for six genes in the candidate region on chromosome 2. This study confirms the existence of common resistance genes in PI 414723 and WM-7.
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Palabras clave

AlignmentBegomovirusBsr-seqChromosome mappingCucumis meloDisease resistanceFormatGene expressioGene expressionGenomeInfectionInheritanceLeveMelonNew-delhi-virusPhenotypePlant diseasesPolymorphism, single nucleotideQtlQuantitative trait lociTolcndvVariantVirus resistanceYellow mosaic-virusZucchini

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 72/320, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-27:

  • WoS: 5
  • Scopus: 6
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-27:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 19.

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 6.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 8 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/89402/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 160
  • Descargas: 25
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Thailand.

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Reconocimientos ligados al ítem

This work was supported by the grant PID2021-125787OR-C33, funded by MICIU/AEI/10.13039/501100011033; the 'FEDER UE' PROMETEO/2021/072 project for excellence groups Conselleria d'Educacio, Cultura, Universitats i Ocupacio (Generalitat Valenciana, Spain); and project RTC-2017-6023-2, funded MICIU/AEI/10.13039/501100011033 and by FEDER 'A way of making Europe'. C.S. was the recipient of a 'Margarita Salas' grant (MS/60) from the Requalification Program for Excellence of the Universitat Politecnica de Valencia, Spanish Ministry of Universities and European Union-Next Generation EU. C.P.M. is a recipient of the predoctoral fellowship "Programa de Ayudas de Investigacion y Desarrollo (PAID-01-19)" from Universitat Politecnica de Valencia. Funding for open access charge: Universitat Politecnica de Valencia (PAID-12-23).
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