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Investigadores/as Institucionales

Ruiz-Padilla, AnaAutor o CoautorDonaire, LiviaAutor o CoautorAyllon, Maria AAutor (correspondencia)

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12 de noviembre de 2024
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Artículo
Sí

Reexamining the Mycovirome of Botrytis spp.

Publicado en: Viruses-Basel. 16 (10): 1640- - 2024-10-01 16(10), DOI: 10.3390/v16101640

Autores:

Muñoz-Suárez, H; Ruiz-Padilla, A; Donaire, L; Benito, EP; Ayllón, MA
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Afiliaciones

CSIC, Ctr Edafol & Biol Aplicada Segura CEBAS, Dept Stress Biol & Plant Pathol, Murcia 30100, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Escuela Tecn Super Ingn Agron Alimentaria & Biosis, Dept Biotecnol Biol Vegetal, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria UPM IN, CSIC, Madrid 28223, Spain - Autor o Coautor
Univ Salamanca, Dept Microbiol & Genet, Inst Invest Agrobiotecnol CIALE, C Rio Duero 12, Salamanca 37185, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Botrytis species cause gray mold disease in more than 200 crops worldwide. To control this disease, chemical fungicides are usually applied. However, more sustainable control alternatives should be explored, such as the use of hypovirulent mycovirus-infected fungal strains. To determine the mycovirome of two Botrytis species, B. cinerea and B. prunorum, we reanalyzed RNA-Seq and small RNA-Seq data using different assembly programs and an updated viral database, aiming to identify new mycoviruses that were previously not described in the same dataset. New mycoviruses were identified, including those previously reported to infect or be associated with B. cinerea and Plasmopara viticola, such as Botrytis cinerea alpha-like virus 1 and Plasmopara viticola lesion-associated ourmia-like virus 80. Additionally, two novel narnaviruses, not previously identified infecting Botrytis species, have been characterized, tentatively named Botrytis cinerea narnavirus 1 and Botrytis narnavirus 1. The analysis of small RNAs suggested that all identified mycoviruses were targeted by the antiviral fungal mechanism, regardless of the viral genome type. In conclusion, the enlarged list of newly found viruses and the application of different bioinformatics approaches have enabled the identification of novel mycoviruses not previously described in Botrytis species, expanding the already extensive list.
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Palabras clave

<italic>botrytis cinerea</italic><italic>botrytis prunorum</italic><italic>narnaviridae</italic>AlignmentAmino acid sequenceAmino acid substitutionAntiviral mechanismArabidopsisArabidopsis thalianaArticleBioinformaticsBluetongue orbivirusBotrytisBotrytis cinereaBotrytis prunorumBotrytis cinereaChestnut blightCinereaClassificationDna extractionDouble-stranded-rnaEvolutionFungal virusesFungusGeneticsGenome, viralHeterobasidionHigh throughput sequencinHigh throughput sequencingHypovirulencIsolation and purificationMetagenomicsMicrobiologyMyceliumMycoviromeMycovirusMycovirusesNarnaviridaeNonhumanPhylogenetic treePhylogenyPlantPlant diseasePlant diseasesPlant immunityPlant virusReconstructionRna extractionRna sequenceRna silencingRna, viralSclerotinia sclerotiorumVirologyViromeVirusVirus genomeVirus rnaWhole genome sequencing

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Viruses-Basel debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Infectious Diseases.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2025-12-21:

  • Scopus: 1
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-12-21:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 2.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 2 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

    Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

    • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
    • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/89302/

    Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

    • Visualizaciones: 155
    • Descargas: 25
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    Análisis de liderazgo de los autores institucionales

    Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Munoz-Suarez, Hugo) y Último Autor (AYLLON TALAVERA, MARIA ANGELES).

    el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido AYLLON TALAVERA, MARIA ANGELES.

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    Reconocimientos ligados al ítem

    This research was funded by Project AGL2009-11778 from Spanish Ministry of Science and Innovation and by VIROPLANT, a project that received funding from the European Union's Horizon 2020 Research and Innovation Program (Grant No. 773567).
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