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Crevillen, PedroAutor o CoautorLopez, Juan A.Autor o CoautorJurado, SilviaAutor o CoautorPineiro, ManuelAutor o CoautorJarillo, Jose A.Autor (correspondencia)

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9 de abril de 2019
Publicaciones
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Artículo

Arabidopsis SWC4 Binds DNA and Recruits the SWR1 Complex to Modulate Histone H2A.Z Deposition at Key Regulatory Genes

Publicado en: Molecular Plant. 11 (6): 815-832 - 2018-06-04 11(6), DOI: 10.1016/j.molp.2018.03.014

Autores:

Gómez-Zambrano, A; Crevillén, P; Franco-Zorrilla, JM; López, JA; Moreno-Romero, J; Roszak, P; Santos-González, J; Jurado, S; Vázquez, J; Köhler, C; Solano, R; Piñeiro, M; Jarillo, JA
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Afiliaciones

CSIC, Genom Unit, Ctr Nacl Biotecnol, E-28049 Madrid, Spain - Autor o Coautor
CSIC, Inst Bioquim Vegetal & Fotosintesis, Seville 41092, Spain - Autor o Coautor
CSIC, Plant Mol Genet Dept, Ctr Nacl Biotecnol, E-28049 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Ctr Nacl Invest Cardiovasc Carlos III CNIC, Lab Cardiovasc Prote, Madrid 28029, Spain - Autor o Coautor
Ctr Nacl Invest Cardiovasc Carlos III CNIC, Prote Unit, Madrid 28029, Spain - Autor o Coautor
Linnean Ctr Plant Biol, S-75652 Uppsala, Sweden - Autor o Coautor
Sainsbury Lab, Cambridge CB2 1LR, England - Autor o Coautor
Swedish Univ Agr Sci, Dept Plant Biol, Uppsala BioCtr, S-75652 Uppsala, Sweden - Autor o Coautor
UB, CRAG, CSIC, IRTA,UAB, Campus UAB, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Campus Montegancedo UPM, Madrid 28223, Spain - Autor o Coautor
Univ Seville, Seville 41092, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Deposition of the H2A.Z histone variant by the SWR1 complex (SWR1-C) in regulatory regions of specific loci modulates transcription. Characterization of mutations in Arabidopsis thaliana homologs of yeast SWR1-C has revealed a role for H2A.Z exchange in a variety of developmental processes. Nevertheless, the exact composition of plant SWR1-C and how it is recruited to target genes remains to be established. Here we show that SWC4, the Arabidopsis homolog of yeast SANT domain protein Swc4/Eaf2, is a DNA-binding protein that interacts with SWR1-C subunits. We demonstrate that the swc4-1 knockout mutant is embryolethal, while SWC4 RNAi knockdown lines display pleiotropic phenotypic alterations in vegetative and reproductive traits, including acceleration of flowering time, indicating that SWC4 controls post-embryonic processes. Transcriptomic analyses and genome-wide profiling of H2A.Z indicate that SWC4 represses transcription of a number of genes, including the floral integrator FT and key transcription factors, mainly by modulating H2A.Z deposition. Interestingly, SWC4 silencing does not affect H2A.Z deposition at the FLClocus nor expression of this gene, a master regulator of flowering previously shown to be controlled by SWR1-C. Importantly, we find that SWC4 recognizes specific AT-rich DNA elements in the chromatin regions of target genes and that SWC4 silencing impairs SWR1-C binding at FT. Collectively, our data suggest that SWC4 regulates plant growth and development by aiding SWR1-C recruitment and modulating H2A.Z deposition.
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Palabras clave

activationchromatinfloral repressionflowering responsesflowering timeh2a.z depositionlocus-c expressionmodifying complexesnua4nuclear actinsant domainswc4swr1 complexvariant h2a.zArabidopsisArabidopsis proteinsChromatinChromatin-remodeling complexDna, plantDna-binding proteinsFlowering timeFlowersGc rich sequenceGene expression regulation, plantGene knockdown techniquesH2a.z depositionHistonesProtein bindingSeedsSwc4Swr1 complex

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Molecular Plant debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2018, se encontraba en la posición 4/228, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.79. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 2.71 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-09, el siguiente número de citas:

  • WoS: 61
  • Scopus: 60
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-09:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 113.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 113 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 12.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 20 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Sweden; United Kingdom.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Gomez-Zambrano, Angeles) y Último Autor (JARILLO QUIROGA, JOSE ANTONIO).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido Gomez-Zambrano, Angeles y JARILLO QUIROGA, JOSE ANTONIO.

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Reconocimientos ligados al ítem

This work was supported by grants BIO2010-15589, BIO2013-43098-R, and BIO2016-77559-R to J.A.J. and M.P., and grant RYC-2013-14689 to P.C. from the Spanish Ministerio de Economia y Competitividad (MINECO/FEDER, EU), and Marie Curie FP7-PEOPLE-2011-IEF grant 298790 to P.C. and J.A.J. from the European Commission. The CBGP is a Severo Ochoa Center of Excellence (SEV-2016-0672). The CNIC is supported by the Spanish Ministerio de Economia, Industria y Competitividad and the Pro CNIC Foundation, and is also a Severo Ochoa Center of Excellence (SEV-2015-0505).
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