{rfName}
Me

Indexado en

Citaciones

60

Altmetrics

Investigadores/as Institucionales

Luengo-Oroz, Miguel A.Autor o CoautorPastor, DavidAutor o CoautorLedesma-Carbayo, MariaAutor o CoautorSantos, AndresAutor o Coautor

Compartir

9 de junio de 2019
Publicaciones
>
Artículo
No

Methodology for Reconstructing Early Zebrafish Development From In Vivo Multiphoton Microscopy

Publicado en: IEEE TRANSACTIONS ON IMAGE PROCESSING. 21 (4): 2335-2340 - 2012-04-01 21(4), DOI: 10.1109/TIP.2011.2177911

Autores:

Luengo-Oroz, MA; Rubio-Guivernau, JL; Faure, E; Savy, T; Duloquin, L; Olivier, N; Pastor, D; Ledesma-Carbayo, M; Débarre, D; Bourgine, P; Beaurepaire, E; Peyriéras, N; Santos, A
[+]

Afiliaciones

Biomat & Nanomed CIBER BBN, Ctr Invest Biomed Red Bioingn, Madrid, Spain - Autor o Coautor
CNRS, Inst Neurobiol Alfred Fessard, F-91198 Gif Sur Yvette, France - Autor o Coautor
Ecole Polytech, Ctr Rech Epistemol Appl, CNRS, F-75015 Paris, France - Autor o Coautor
Ecole Polytech, Lab Opt & Biosci, CNRS, INSERM, F-91128 Palaiseau, France - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Biomed Image Technol Lab ETSI Telecomunicac, E-28040 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Ver más

Resumen

Investigating cell dynamics during early zebrafish embryogenesis requires specific image acquisition and analysis strategies. Multiharmonic microscopy, i.e., second-and third-harmonic generations, allows imaging cell divisions and cell membranes in unstained zebrafish embryos from 1- to 1000-cell stage. This paper presents the design and implementation of a dedicated image processing pipeline (tracking and segmentation) for the reconstruction of cell dynamics during these developmental stages. This methodology allows the reconstruction of the cell lineage tree including division timings, spatial coordinates, and cell shape until the 1000-cell stage with minute temporal accuracy and micrometer spatial resolution. Data analysis of the digital embryos provides an extensive quantitative description of early zebrafish embryogenesis.
[+]

Palabras clave

3rd-harmonic generation microscopyBiologyCell lineage treeCellsEmbryoEmbryogenesisEmbryosImage reconstructionImagesIn vivo 4-d imagingMicroscopyMultiphoton microscopyPipelinesSegmentationThree dimensional displaysTimingViscous watershedZebrafish

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista IEEE TRANSACTIONS ON IMAGE PROCESSING debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2012, se encontraba en la posición 13/115, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Computer Science, Artificial Intelligence.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-08:

  • Google Scholar: 20
  • WoS: 15
  • Scopus: 17
  • Europe PMC: 8
[+]

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-08:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 42.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 42 (PlumX).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/15972/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 502
  • Descargas: 734
[+]

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: France.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Luengo Oroz, Miguel Angel) y Último Autor (SANTOS LLEO, ANDRES DE).

[+]

Reconocimientos ligados al ítem

This work was supported in part by Spain's Ministry of Science and Innovation under Project TEC2010-21619-C04-03, Project TEC2008-06715-C02-02, Project CDTI-CENIT (AMIT) and Project INNPACTO (PRECISION), by Comunidad de Madrid (ARTEMIS), by French Program ANR and Program ARC, by the European Regional Development Funds (FEDER), and by Europe FP6 NEST. The associate editor coordinating the review of this manuscript and approving it for publication was Prof. David S. Taubman.
[+]