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9 de junio de 2019
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Sortin2 enhances endocytic trafficking towards the vacuole in Saccharomyces cerevisiae

Publicado en: Biological Research. 48 (UNSP 39): 39- - 2015-12-23 48(UNSP 39), DOI: 10.1186/s40659-015-0032-9

Autores:

Vásquez-Soto, B; Manríquez, N; Cruz-Amaya, M; Zouhar, J; Raikhel, NV; Norambuena, L
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Afiliaciones

Univ Calif Riverside, Ctr Plant Cell Biol, Dept Bot & Plant Sci - Autor o Coautor
Univ Chile, Ctr Plant Mol Biol, Dept Biol, Fac Sci - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Ctr Biotecnol & Genom Plantas - Autor o Coautor
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Resumen

Background: A highly regulated trafficking of cargo vesicles in eukaryotes performs protein delivery to a variety of cellular compartments of endomembrane system. The two main routes, the secretory and the endocytic pathways have pivotal functions in uni- and multi-cellular organisms. Protein delivery and targeting includes cargo recognition, vesicle formation and fusion. Developing new tools to modulate protein trafficking allows better understanding the endomembrane system mechanisms and their regulation. The compound Sortin2 has been described as a protein trafficking modulator affecting targeting of the vacuolar protein carboxypeptidase Y (CPY), triggering its secretion in Saccharomyces cerevisiae. Results: A reverse chemical-genetics approach was used to identify key proteins for Sortin2 bioactivity. A genome-wide Sortin2 resistance screen revealed six yeast deletion mutants that do not secrete CPY when grown at Sortin2 condition where the parental strain does: met18, sla1, clc1, dfg10, dpl1 and yjl175w. Integrating mutant phenotype and gene ontology annotation of the corresponding genes and their interactome pointed towards a high representation of genes involved in the endocytic process. In wild type yeast endocytosis towards the vacuole was faster in presence of Sortin2, which further validates the data of the genome-wide screen. This effect of Sortin2 depends on structural features of the molecule, suggesting compound specificity. Sortin2 did not affect endocytic trafficking in Sortin2-resistant mutants, strongly suggesting that the Sortin2 effects on the secretory and endocytic pathways are linked. Conclusions: Overall, the results reveal that Sortin2 enhances the endocytic transport pathway in Saccharomyces cerevisiae. This cellular effect is most likely at the level where secretory and endocytic pathways are merged. Them Sortin2 specificity over the endomembrane system places it as a powerful biological modulator for cell biology.
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Palabras clave

AlkanesulfonatesBiological transportBudding yeastChemical geneticsClathrinCortical actin cytoskeletonDissectionDynamicsEndocytosisPhenotypePlant proteinsProteinProtein transportRhodanineSaccharomyces cerevisiaeSecretory pathwaySla1pSmall moleculesSortin2TargetTrafficking modulatorVacuoles

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Biological Research debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2015, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoría Agricultural and Biological Sciences (Miscellaneous). Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada en el Cuartil Q3 para la agencia WoS (JCR) en la categoría Biology.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-01-14:

  • WoS: 6
  • Scopus: 5
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-01-14:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 30.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 30 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 2.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 4 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://oa.upm.es/41453/

Como resultado de la publicación del trabajo en el repositorio institucional, se han obtenido datos estadísticos de uso que reflejan su impacto. En términos de difusión, podemos afirmar que, hasta la fecha

  • Visualizaciones: 344
  • Descargas: 209
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Chile; United States of America.

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Reconocimientos ligados al ítem

FONDECYT 11080240 and 1120289 (to BV-S, NM, MC-A and LN), PCB-MN P006-065-F (to NM and LN) and NSF MCB0515963 (to JZ and NVR).
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