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Grant support

We thank Dr D. Scheel (Leibniz Institute of Plant Biochemistry, Germany), Dr C. Zipfel (Sainsbury Laboratory, UK), Dr T. Nurnberger and Dr Andrea Gust (University of Tubingen, Germany), Dr M. Knight (Durham University, UK) and Dr J. E. Parker (Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Cologne) for providing biological materials. We thank the Megazyme Technical Support Team and Dr Benoit Darblade (Elicytil, France) for providing quality control analyses of the MAMPs/DAMPs used in this article. The MALDI-TOF MS analyses were performed in the Proteomics Unit of Complutense University of Madrid that belongs to ProteoRed (PRB2-ISCIII supported by grant PT13/0001). This work was supported by Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (MINECO) grants BIO2015-64077-R and BIO2012-32910 to AM and BIO2013-41403-R to LFP. HM was funded by an IEF grant (Sign-WALLINg-624721) from the European Union and LB was recipient of a FPI fellowship (BES-2013-065010) from MINECO.

Análisis de autorías institucional

Melida, HugoAutor o CoautorSopena-Torres, SaraAutor (correspondencia)Bacete, LauraAutor o CoautorGarrido-Arandia, MariaAutor o CoautorJorda, LuciaAutor o CoautorLopez, GemmaAutor o CoautorMunoz-Barrios, AntonioAutor o CoautorPacios, Luis F.Autor (correspondencia)Molina, AntonioAutor (correspondencia)

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9 de junio de 2019
Publicaciones
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Artículo

Non-branched-1,3-glucan oligosaccharides trigger immune responses in Arabidopsis

Publicado en:Plant Journal. 93 (1): 34-49 - 2018-01-01 93(1), DOI: 10.1111/tpj.13755

Autores: Melida, Hugo; Sopena-Torres, Sara; Bacete, Laura; Garrido-Arandia, Maria; Jorda, Lucia; Lopez, Gemma; Munoz-Barrios, Antonio; Pacios, Luis F.; Molina, Antonio;

Afiliaciones

UPM, Escuela Tecn Super Ingn Agron Alimentaria & Biosi, Dept Biotecnol Biol Vegetal, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
UPM, Escuela Tecn Super Ingn Montes, Dept Sistemas & Recursos Nat, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
UPM, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Campus Montegancedo UPM, Pozuelo De Alarcon 28223, Madrid, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Fungal cell walls, which are essential for environmental adaptation and host colonization by the fungus, have been evolutionarily selected by plants and animals as a source of microbe-associated molecular patterns (MAMPs) that, upon recognition by host pattern recognition receptors (PRRs), trigger immune responses conferring disease resistance. Chito-oligosaccharides [-1,4-N-acetylglucosamine oligomers, (GlcNAc)(n)] are the only glycosidic structures from fungal walls that have been well-demonstrated to function as MAMPs in plants. Perception of (GlcNAc)(4-8) by Arabidopsis involves CERK1, LYK4 and LYK5, three of the eight members of the LysM PRR family. We found that aglucan-enriched wall fraction from the pathogenic fungus Plectosphaerella cucumerina which was devoid of GlcNAc activated immune responses in Arabidopsis wild-type plants but not in the cerk1 mutant. Using this differential response, we identified the non-branched 1,3--d-(Glc) hexasaccharide as a major fungal MAMP. Recognition of 1,3--d-(Glc)(6) was impaired in cerk1 but not in mutants defective in either each of the LysM PRR family members or in the PRR-co-receptor BAK1. Transcriptomic analyses of Arabidopsis plants treated with 1,3--d-(Glc)(6) further demonstrated that this fungal MAMP triggers the expression of immunity-associated genes. In silico docking analyses with molecular mechanics and solvation energy calculations corroborated that CERK1 can bind 1,3--d-(Glc)(6) at effective concentrations similar to those of (GlcNAc)(4). These data support that plants, like animals, have selected as MAMPs the linear 1,3--d-glucans present in the walls of fungi and oomycetes. Our data also suggest that CERK1 functions as an immune co-receptor for linear 1,3--d-glucans in a similar way to its proposed function in the recognition of fungal chito-oligosaccharides and bacterial peptidoglycan MAMPs. Significance statement Despite pioneering work and recently regained momentum, the plant-specific knowledge about the mechanisms of -glucan perception and its role in activation of plant defence clearly lags behind the animal field. This article demonstrates that Arabidopsis can perceive non-branched 1,3--glucans of various degrees of polymerization and that this recognition is at least partially mediated by CERK1, but it does not involve BAK1, the co-receptor of other PRRs.

Palabras clave

cerkbak1cell wallchitinglucannecrotrophic fungiArabidopsisArabidopsis proteinsAscomycotaBacterial elicitor flagellinBak1Beta-glucansCell wallCerkChitinDefense responsesDisease resistanceFungal cell-wallGlucanHeterotrimeric g-proteinHost-pathogen interactionsInnate immunityMolecular-patternsMycelial wallsNecrotrophic fungiOligosaccharidesPlant diseasesPlant immunityProtein serine-threonine kinasesReceptor-like kinaseReceptors, pattern recognition

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plant Journal debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2018, se encontraba en la posición 11/228, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 3.04. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 5.29 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 13.39 (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-12, el siguiente número de citas:

  • WoS: 74
  • Scopus: 117
  • Europe PMC: 7

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-12:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 143.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 145 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 15.75.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 2 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 19 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (MELIDA MARTINEZ, HUGO) y Último Autor (MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido SOPEÑA TORRES, SARA, FERNANDEZ PACIOS, LUIS y MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO.