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The authors thank Roberto Solano and Andrea Chini (Centro Nacional de Biotecnologia, CNB-CSIC, Madrid) for kindly sharing the myc loss-of-function lines with us. In addition, the authors appreciate the thoughtful feedback and highly valuable comments by all members of the CBGP laboratories 127 and 132. This research was funded by the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (MINECO), grant number BFU2017-82826-R to S.P.

Análisis de autorías institucional

Perez-Alonso, MmAutor (correspondencia)Sanchez-Parra, BAutor o CoautorOrtiz-Garcia, PAutor o CoautorSantamaria, MeAutor o CoautorDiaz, IAutor o CoautorPollmann, SAutor (correspondencia)

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11 de octubre de 2021
Publicaciones
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Artículo
Sí

Jasmonic Acid-Dependent MYC Transcription Factors Bind to a Tandem G-Box Motif in the YUCCA8 and YUCCA9 Promoters to Regulate Biotic Stress Responses

Publicado en:International Journal Of Molecular Sciences. 22 (18): 9768- - 2021-09-01 22(18), DOI: 10.3390/ijms22189768

Autores: Perez-Alonso, Marta-Marina; Sanchez-Parra, Beatriz; Ortiz-Garcia, Paloma; Santamaria, Maria Estrella; Diaz, Isabel; Pollmann, Stephan

Afiliaciones

Karl Franzens Univ Graz, Bereich Pflanzenwissensch, Inst Biol, A-8010 Graz, Austria - Autor o Coautor
Swedish Univ Agr Sci, Umea Plant Sci Ctr UPSC, Dept Forest Genet & Plant Physiol, S-90183 Umea, Sweden - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Escuela Tecn Super Ingn Agron Alimentaria & Biosi, Dept Biotecnol Biol Vegetal, Madrid 28040, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentac INIA, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Pozuelo De Alarcon 28223, Spain - Autor o Coautor

Resumen

The indole-3-pyruvic acid pathway is the main route for auxin biosynthesis in higher plants. Tryptophan aminotransferases (TAA1/TAR) and members of the YUCCA family of flavin-containing monooxygenases catalyze the conversion of l-tryptophan via indole-3-pyruvic acid to indole-3-acetic acid (IAA). It has been described that jasmonic acid (JA) locally produced in response to mechanical wounding triggers the de novo formation of IAA through the induction of two YUCCA genes, YUC8 and YUC9. Here, we report the direct involvement of a small number of basic helix-loop-helix transcription factors of the MYC family in this process. We show that the JA-mediated regulation of the expression of the YUC8 and YUC9 genes depends on the abundance of MYC2, MYC3, and MYC4. In support of this observation, seedlings of myc knockout mutants displayed a strongly reduced response to JA-mediated IAA formation. Furthermore, transactivation assays provided experimental evidence for the binding of MYC transcription factors to a particular tandem G-box motif abundant in the promoter regions of YUC8 and YUC9, but not in the promoters of the other YUCCA isogenes. Moreover, we demonstrate that plants that constitutively overexpress YUC8 and YUC9 show less damage after spider mite infestation, thereby underlining the role of auxin in plant responses to biotic stress signals.

Palabras clave

Arabidopsis proteinsArabidopsis thalianaArabidopsis-thalianaAuxin biosynthesisBiotic stressCyclopentanesEscherichia-coliEthylene biosynthesisG-box binding factorsGene expression regulation, plantGene-expressionGrowthGrowth-defense trade-offHeterodimerizationHormone crosstalkIndole-3-acetic acidIndoleacetic acidsJasmonic acidMixed function oxygenasesNucleotide motifsOxylipinsPlant hormone crosstalkPlant-resistancePromoter regions, geneticProtein bindingProto-oncogene proteins c-mycStress, physiologicalTrade-offsTranscriptional regulationWound response

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista International Journal Of Molecular Sciences debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2021, se encontraba en la posición 69/297, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.19. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.49 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 5.37 (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-20, el siguiente número de citas:

  • WoS: 23
  • Scopus: 29
  • Google Scholar: 18

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-20:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 30.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 32 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 6.45.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 11 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Austria; Sweden.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Perez Alonso, Marta Marina) y Último Autor (POLLMANN, STEPHAN).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido Perez Alonso, Marta Marina y POLLMANN, STEPHAN.