Synthetic biology open language visual (SBOL Visual) version 2.3
Publicado en:Journal Of Integrative Bioinformatics. 18 (3): - 2021-06-08 18(3), DOI: 10.1515/jib-2020-0045
Autores: Baig H; Fontanarossa P; Kulkarni V; McLaughlin J; Vaidyanathan P; Bartley B; Bhakta S; Bhatia S; Bissell M; Clancy K; Cox RS; Goñi Moreno A; Gorochowski T; Grunberg R; Lee J; Luna A; Madsen C; Misirli G; Nguyen T; Le Novere N; Palchick Z; Pocock M; Roehner N; Sauro H; Scott-Brown J; Sexton JT; Stan GB; Tabor JJ; Terry L; Vazquez Vilar M; Voigt CA; Wipat A; Zong D; Zundel Z; Beal J; Myers C
Afiliaciones
Resumen
People who are engineering biological organisms often find it useful to communicate in diagrams, both about the structure of the nucleic acid sequences that they are engineering and about the functional relationships between sequence features and other molecular species. Some typical practices and conventions have begun to emerge for such diagrams. The Synthetic Biology Open Language Visual (SBOL Visual) has been developed as a standard for organizing and systematizing such conventions in order to produce a coherent language for expressing the structure and function of genetic designs. This document details version 2.3 of SBOL Visual, which builds on the prior SBOL Visual 2.2 in several ways. First, the specification now includes higher-level interactions with interactions, such as an inducer molecule stimulating a repression interaction. Second, binding with a nucleic acid backbone can be shown by overlapping glyphs, as with other molecular complexes. Finally, a new unspecified interaction glyph is added for visualizing interactions whose nature is unknown, the insulator glyph is deprecated in favor of a new inert DNA spacer glyph, and the polypeptide region glyph is recommended for showing 2A sequences.
Palabras clave
Indicios de calidad
Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión
El trabajo ha sido publicado en la revista Journal Of Integrative Bioinformatics debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2021, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Medicine (Miscellaneous).
Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 1.05, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)
De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-20, el siguiente número de citas:
- Scopus: 6
Impacto y visibilidad social
Análisis de liderazgo de los autores institucionales
Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Gran Bretanya; Japan; Saudi Arabia; United Kingdom; United States of America.