Publicacions
>
Article

Enhancing Microbiome Research through Genome-Scale Metabolic Modeling

Publicat a:Msystems. 6 (6): - 2021-01-01 6(6), DOI: 10.1128/mSystems.00599-21

Autors: Ankrah NYD; Bernstein DB; Biggs M; Carey M; Engevik M; García-Jiménez B; Lakshmanan M; Pacheco AR; Sulheim S; Medlock GL

Afiliacions

Resum

Construction and analysis of genome-scale metabolic models (GEMs) is a well-established systems biology approach that can be used to predict metabolic and growth phenotypes. The ability of GEMs to produce mechanistic insight into microbial ecological processes makes them appealing tools that can open a range of exciting opportunities in microbiome research. Here, we briefly outline these opportunities, present current rate-limiting challenges for the trustworthy application of GEMs to microbiome research, and suggest approaches for moving the field forward. © 2021 Ankrah et al.

Paraules clau

ArticleMetabolic modelingMetabolismMicrobiomeNonhuman

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Msystems a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició 27/137, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Microbiology.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 2.25, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 4.95 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-07, el següent nombre de cites:

  • Scopus: 25
  • OpenCitations: 21

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-07:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 91.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 91 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 54.13.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 84 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Norway; Singapore; Switzerland; United States of America.