{rfName}
Ja

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

70

Altmetrics

Article has an altmetric score of 7

Grant support

The authors thank Roberto Solano and Andrea Chini (Centro Nacional de Biotecnologia, CNB-CSIC, Madrid) for kindly sharing the myc loss-of-function lines with us. In addition, the authors appreciate the thoughtful feedback and highly valuable comments by all members of the CBGP laboratories 127 and 132. This research was funded by the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (MINECO), grant number BFU2017-82826-R to S.P.

Anàlisi d'autories institucional

Perez-Alonso, MmAutor (correspondència)Sanchez-Parra, BAutor o coautorOrtiz-Garcia, PAutor o coautorSantamaria, MeAutor o coautorDiaz, IAutor o coautorPollmann, SAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

Jasmonic Acid-Dependent MYC Transcription Factors Bind to a Tandem G-Box Motif in the YUCCA8 and YUCCA9 Promoters to Regulate Biotic Stress Responses

Publicat a:International Journal Of Molecular Sciences. 22 (18): 9768- - 2021-09-01 22(18), DOI: 10.3390/ijms22189768

Autors: Perez-Alonso, Marta-Marina; Sanchez-Parra, Beatriz; Ortiz-Garcia, Paloma; Santamaria, Maria Estrella; Diaz, Isabel; Pollmann, Stephan

Afiliacions

Resum

The indole-3-pyruvic acid pathway is the main route for auxin biosynthesis in higher plants. Tryptophan aminotransferases (TAA1/TAR) and members of the YUCCA family of flavin-containing monooxygenases catalyze the conversion of l-tryptophan via indole-3-pyruvic acid to indole-3-acetic acid (IAA). It has been described that jasmonic acid (JA) locally produced in response to mechanical wounding triggers the de novo formation of IAA through the induction of two YUCCA genes, YUC8 and YUC9. Here, we report the direct involvement of a small number of basic helix-loop-helix transcription factors of the MYC family in this process. We show that the JA-mediated regulation of the expression of the YUC8 and YUC9 genes depends on the abundance of MYC2, MYC3, and MYC4. In support of this observation, seedlings of myc knockout mutants displayed a strongly reduced response to JA-mediated IAA formation. Furthermore, transactivation assays provided experimental evidence for the binding of MYC transcription factors to a particular tandem G-box motif abundant in the promoter regions of YUC8 and YUC9, but not in the promoters of the other YUCCA isogenes. Moreover, we demonstrate that plants that constitutively overexpress YUC8 and YUC9 show less damage after spider mite infestation, thereby underlining the role of auxin in plant responses to biotic stress signals.

Paraules clau

Arabidopsis proteinsArabidopsis thalianaArabidopsis-thalianaAuxin biosynthesisBiotic stressCyclopentanesEscherichia-coliEthylene biosynthesisG-box binding factorsGene expression regulation, plantGene-expressionGrowthGrowth-defense trade-offHeterodimerizationHormone crosstalkIndole-3-acetic acidIndoleacetic acidsJasmonic acidMixed function oxygenasesNucleotide motifsOxylipinsPlant hormone crosstalkPlant-resistancePromoter regions, geneticProtein bindingProto-oncogene proteins c-mycStress, physiologicalTrade-offsTranscriptional regulationWound response

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista International Journal Of Molecular Sciences a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició 69/297, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemistry & Molecular Biology.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.19. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.49 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 5.37 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-02, el següent nombre de cites:

  • WoS: 23
  • Scopus: 29
  • Google Scholar: 18
  • OpenCitations: 16

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 32.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 32 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 6.45.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 11 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Austria; Sweden.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Perez Alonso, Marta Marina) i Últim Autor (POLLMANN, STEPHAN).

els autors responsables d'establir les tasques de correspondència han estat Perez Alonso, Marta Marina i POLLMANN, STEPHAN.