Publicacions
>
Article

Marker assisted backcrossing for introgression of Fusarium wilt resistance gene into melon

Publicat a:Euphytica. 214 (1): - 2018-01-01 214(1), DOI: 10.1007/s10681-017-2080-4

Autors: Sousaraei, Naeimeh; Ramshini, Hossein; Lotfi, Mahmoud; Sharzei, Abbas;

Afiliacions

Resum

Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. melonis is a common vascular wilt fungal disease in melon across the world. The resistance gene to race 1 of this causal agent, Fom-2, has been previously cloned and its sequence is available. The objective of this research was the introgression of Fom-2 from one resistant (Isabelle) genotype into two susceptible cultivars (Garmak and Tile-torogh) via marker assisted backcrossing. First, the leucine-rich repeats (LRR) domain of Fom-2 from resistant and susceptible genotypes was sequenced to develop functional markers. A length of 1274 bp of the 30 end of this gene was isolated, cloned and sequenced. The difference between resistant and susceptible genotypes in this region was 28 nucleotide substitutions. Two allele specific primer pairs, Fom2-R409 and Fom2-S253, were designed based on nucleotide substitutions to amplify resistant and susceptible alleles, respectively. For introgression of the gene, donor (Isabelle) and recurrent (Garmak and Tile-torogh) parents were crossed. Resistant plants in BC1F1 and BC2F1 generations were first detected using artificial pathogen inoculation and later the plants were genotyped by functional markers to validate their resistance. The resistant plants were also selected phenotypically in each generation for background genome recovery, which conduced to high similarity of BC3 generation with the recurrent parents. It was proved the developed markers are more precise and efficient than inoculation trial and could be used as confident tools for screening of resistant melon genotypes to Fusarium wilt.

Paraules clau

Allele specific pcrCucumis meloFom-2Leucine-rich repeatsMarker assisted selectionRacesSequence characterized amplified regions

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Euphytica a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2018, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Horticulture.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-06-04:

  • WoS: 1
  • Scopus: 9
  • OpenCitations: 5

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-04:

  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 34 (PlumX).

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (SOUSARAEI, NAEIMEH) .